More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2917 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 415 aa  856    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  55.58 
 
 		 413 aa  485  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  55.42 
 
 		 408 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  55.69 
 
 		 414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  53.64 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  53.71 
 
 		 414 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  54.83 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  52.2 
 
 		 422 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  54.21 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  56.09 
 
 		 410 aa  461  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  53.27 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  52.45 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  53.81 
 
 		 413 aa  451  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  53.47 
 
 		 409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  53.58 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  50.98 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  49.75 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  48.88 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  54.17 
 
 		 408 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  51.64 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  48.74 
 
 		 410 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  50 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  50.25 
 
 		 416 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  47.57 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  49.63 
 
 		 416 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  50.13 
 
 		 397 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  49.62 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  48.98 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  47.47 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  47.5 
 
 		 413 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  48.35 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  50 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  49.75 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  50 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  48.22 
 
 		 399 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  44.9 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  46.63 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  44.33 
 
 		 413 aa  349  5e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  44.25 
 
 		 423 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  43.86 
 
 		 409 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  43.86 
 
 		 409 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  43.86 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  41.69 
 
 		 418 aa  331  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  37.62 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.85 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  38.23 
 
 		 404 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  38.98 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  37.31 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  37.06 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  36.99 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  36.2 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  38.36 
 
 		 394 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  38.36 
 
 		 394 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  36.73 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  36.73 
 
 		 404 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  36.66 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  37.12 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  37.12 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  36.68 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  38.5 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.5 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  37.28 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  38.48 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  37.44 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.98 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  34.66 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  36.18 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  37.05 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  36.69 
 
 		 397 aa  263  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  35.24 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  36.96 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  38.08 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  35.55 
 
 		 395 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  36.27 
 
 		 387 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  36.72 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  36.78 
 
 		 419 aa  257  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  36.36 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  36.22 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  36.36 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  35.61 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  34.51 
 
 		 412 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  36.71 
 
 		 417 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  34.28 
 
 		 410 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  34.79 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  35.65 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.13 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  35.44 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  36.9 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  36.48 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  35.13 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  36.39 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  34.56 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  35.11 
 
 		 410 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  35 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  37.19 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  36 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  35.71 
 
 		 401 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  34.24 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  34.24 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  34.43 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>