More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003253 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  100 
 
 		 448 aa  937    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  41.15 
 
 		 410 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  40.23 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  40 
 
 		 411 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  38.85 
 
 		 411 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  38.85 
 
 		 411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  38.76 
 
 		 411 aa  298  9e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  36.34 
 
 		 418 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  39.08 
 
 		 409 aa  296  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  39.17 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  37.21 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  38.98 
 
 		 415 aa  287  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  37.27 
 
 		 417 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  37.44 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  37.21 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  36.22 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  37.13 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  36.16 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  38.05 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  35.07 
 
 		 418 aa  279  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  35.63 
 
 		 418 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  36.47 
 
 		 412 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  36.05 
 
 		 422 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  36.7 
 
 		 414 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  36.24 
 
 		 408 aa  255  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  35.15 
 
 		 402 aa  253  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  35.07 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  35.37 
 
 		 416 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  33.1 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  33.02 
 
 		 399 aa  249  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  35.52 
 
 		 416 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 397 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  35.65 
 
 		 409 aa  246  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  32.39 
 
 		 398 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  35.92 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  34.47 
 
 		 413 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  33.57 
 
 		 409 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  33.57 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  33.57 
 
 		 409 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  32.72 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  33.18 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  32.3 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  32.4 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  31.95 
 
 		 418 aa  219  6e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  33.02 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  33.02 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  29.98 
 
 		 404 aa  204  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  30.54 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  31.13 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  30.64 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  31.13 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  30.07 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.41 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  28.83 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.41 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  29.41 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  30.66 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  30.42 
 
 		 404 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  30.42 
 
 		 404 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  30.05 
 
 		 404 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  29.18 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  29.67 
 
 		 407 aa  194  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  30.82 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  28.91 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  30.68 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  28.61 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  27.9 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  28.67 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  29.01 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  28.31 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  28.8 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  29.27 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  28.44 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  28.94 
 
 		 404 aa  187  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  30.39 
 
 		 419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  28.08 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  28.98 
 
 		 401 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  28.57 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  27.56 
 
 		 419 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  27.56 
 
 		 419 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  29.69 
 
 		 391 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.44 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  29.62 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  28.98 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  28.2 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  27.21 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  27.79 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  28.48 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  28.07 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  27.1 
 
 		 403 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  28.37 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  28.41 
 
 		 419 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  28.41 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  29.88 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  27.45 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  28.6 
 
 		 402 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>