More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2892 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  88.02 
 
 		 409 aa  755    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  88.02 
 
 		 409 aa  755    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  87.23 
 
 		 436 aa  756    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  100 
 
 		 423 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  49.38 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  48.62 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  48.14 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  48.37 
 
 		 403 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  47.67 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  48.37 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  47.5 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  46.63 
 
 		 413 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  47.5 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  48 
 
 		 418 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  46.13 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  45.36 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  46.95 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  45.97 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  45.61 
 
 		 418 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  45.14 
 
 		 409 aa  359  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  45.64 
 
 		 413 aa  359  7e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  45 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  44.89 
 
 		 416 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  43.64 
 
 		 416 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  45.39 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  44.25 
 
 		 413 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  43.52 
 
 		 418 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  43.5 
 
 		 409 aa  348  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  45 
 
 		 413 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  43.64 
 
 		 410 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  43.75 
 
 		 410 aa  342  8e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  44.25 
 
 		 415 aa  340  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  44.78 
 
 		 416 aa  338  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  40.64 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  40.5 
 
 		 413 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  42.25 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  40.29 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  40.65 
 
 		 408 aa  298  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  40.55 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  40 
 
 		 411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  40 
 
 		 411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  39.76 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  37.66 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  35.01 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  33.99 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.44 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  37.06 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  37.78 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  37.06 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  37.17 
 
 		 419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  38.42 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  35.52 
 
 		 418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  38.27 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  37.56 
 
 		 410 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  36.93 
 
 		 419 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  35.71 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  35.52 
 
 		 418 aa  252  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  36.29 
 
 		 417 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  35.44 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  35.41 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  34.13 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  33.92 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.3 
 
 		 422 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  33.89 
 
 		 449 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  33.67 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  33.67 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  35.5 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  35.04 
 
 		 419 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  34.44 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  37.22 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  34.44 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  36.32 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  35.1 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  33.81 
 
 		 419 aa  243  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  36.14 
 
 		 410 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  35.71 
 
 		 389 aa  243  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  34.02 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  35.71 
 
 		 397 aa  242  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  33.74 
 
 		 419 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  35.34 
 
 		 404 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  35.38 
 
 		 387 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  35.85 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  33.18 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  34.95 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  35.43 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  36.62 
 
 		 429 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  33.67 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  33.67 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  33.66 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  35.54 
 
 		 402 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  33.41 
 
 		 424 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  33.01 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  32.93 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  34.32 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  35.01 
 
 		 423 aa  230  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  33.59 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 403 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  31.73 
 
 		 421 aa  229  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  33.41 
 
 		 421 aa  229  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  32.94 
 
 		 419 aa  229  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>