More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1370 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  100 
 
 		 399 aa  818    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  82.46 
 
 		 403 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  78.59 
 
 		 402 aa  664    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  72.86 
 
 		 398 aa  621  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  74.36 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  72.08 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  57.69 
 
 		 413 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  59.34 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  59.23 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  58.06 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  54.46 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  54.22 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  52.16 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  52.28 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  49.87 
 
 		 414 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  50.25 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  50 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  49.36 
 
 		 413 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  50.39 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  47.34 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  48.47 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  49.11 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  49.23 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  49.01 
 
 		 409 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  49.01 
 
 		 436 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  49.38 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  49.01 
 
 		 409 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  49.75 
 
 		 412 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  47.33 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  48.46 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  46.67 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  48.22 
 
 		 415 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  45.76 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  46.29 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  46.11 
 
 		 411 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  46.08 
 
 		 411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  46.08 
 
 		 411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  45.57 
 
 		 411 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  44.27 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  43.91 
 
 		 414 aa  338  7e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2895  phage integrase family protein  95.29 
 
 		 176 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2981  phage integrase family protein  94.71 
 
 		 176 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.551664  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  41.65 
 
 		 416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  42.64 
 
 		 408 aa  315  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  40.85 
 
 		 418 aa  310  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  39.23 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  40.58 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  40.58 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  38.6 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  40.05 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  40.26 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  40.31 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  37.08 
 
 		 404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  39.01 
 
 		 396 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  39.69 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  38.28 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  36.98 
 
 		 404 aa  282  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  39.9 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.32 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  36.46 
 
 		 404 aa  279  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.64 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  39.06 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  36.46 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  37.08 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  37.37 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.34 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  37.34 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  40.1 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  36.65 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  37.08 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.08 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  36.39 
 
 		 404 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  36.39 
 
 		 404 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  36.39 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  37.15 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  37.76 
 
 		 412 aa  268  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  36.18 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  37.21 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  39.01 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0316  phage family integrase  88 
 
 		 160 aa  262  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  36.43 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  36.43 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  34.08 
 
 		 420 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  34.96 
 
 		 402 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  35.62 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  37.82 
 
 		 393 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  35.82 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  33.02 
 
 		 448 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  35.4 
 
 		 404 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  34.75 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  37.25 
 
 		 367 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  38.34 
 
 		 397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  35.14 
 
 		 406 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  36.01 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  35.32 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  34.59 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  36.36 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.34 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  36.34 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  34.59 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>