More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0316 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0316  phage family integrase  100 
 
 		 160 aa  323  5e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2981  phage integrase family protein  91.67 
 
 		 176 aa  281  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.551664  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2895  phage integrase family protein  89.1 
 
 		 176 aa  278  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  88 
 
 		 399 aa  262  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  64.67 
 
 		 403 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  66.42 
 
 		 402 aa  197  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  55.33 
 
 		 398 aa  177  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  56 
 
 		 397 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  53.95 
 
 		 395 aa  169  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  45.26 
 
 		 413 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  49.25 
 
 		 423 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  47.76 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  47.76 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  47.76 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  47.86 
 
 		 416 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  39.71 
 
 		 413 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  42.65 
 
 		 415 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  45.71 
 
 		 416 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  43.48 
 
 		 413 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  45.26 
 
 		 409 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  40.44 
 
 		 414 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  40.88 
 
 		 417 aa  117  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  40.6 
 
 		 410 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  40.44 
 
 		 418 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  39.71 
 
 		 418 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2883  phage integrase family protein  39.57 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  41.41 
 
 		 418 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  37.5 
 
 		 408 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  39.42 
 
 		 416 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  42.34 
 
 		 413 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  36.76 
 
 		 409 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  36.76 
 
 		 419 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  37.5 
 
 		 415 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  36.76 
 
 		 422 aa  104  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  35.29 
 
 		 412 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  37.58 
 
 		 410 aa  100  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  39.71 
 
 		 409 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  36.03 
 
 		 410 aa  97.4  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  38.41 
 
 		 389 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  38.97 
 
 		 417 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0519  phage integrase  35.97 
 
 		 434 aa  94  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  38.24 
 
 		 394 aa  94  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  38.24 
 
 		 394 aa  94  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  33.82 
 
 		 404 aa  92.8  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  34.81 
 
 		 416 aa  92  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  37.5 
 
 		 396 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  36.57 
 
 		 415 aa  91.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  36.03 
 
 		 404 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  37.23 
 
 		 419 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  32.85 
 
 		 420 aa  90.5  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  34.31 
 
 		 411 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  35.81 
 
 		 418 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  36.69 
 
 		 418 aa  89.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  38.85 
 
 		 396 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2464  phage integrase  30.37 
 
 		 216 aa  88.2  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.498064  normal  0.0519347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  40.15 
 
 		 404 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  35.29 
 
 		 404 aa  87.8  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  37.82 
 
 		 413 aa  87.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  35.56 
 
 		 387 aa  87.8  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  41.01 
 
 		 421 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  34.56 
 
 		 413 aa  87.4  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  38.24 
 
 		 400 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  33.11 
 
 		 404 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  34.85 
 
 		 414 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  35.14 
 
 		 418 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  35.77 
 
 		 406 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  38.24 
 
 		 412 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  35.61 
 
 		 394 aa  84  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.36 
 
 		 402 aa  84  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  33.82 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  37.23 
 
 		 396 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  32.35 
 
 		 402 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  36.92 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  31.76 
 
 		 404 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1011  integrase  35.04 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 404 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  37.68 
 
 		 403 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  32.19 
 
 		 412 aa  80.9  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  34.46 
 
 		 417 aa  80.9  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  31.08 
 
 		 404 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  33.09 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  33.77 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  37.5 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  32.86 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  32.86 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  32.86 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  33.58 
 
 		 403 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  33.57 
 
 		 413 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0451  integrase family protein  32.12 
 
 		 416 aa  78.6  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  30.15 
 
 		 404 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  29.41 
 
 		 404 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  34.29 
 
 		 391 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  34.29 
 
 		 387 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.23 
 
 		 422 aa  78.2  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.35 
 
 		 438 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  35.92 
 
 		 643 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  28.68 
 
 		 404 aa  77.4  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  34.46 
 
 		 423 aa  77.4  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  36.5 
 
 		 275 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  31.62 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>