More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2883 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2883  phage integrase family protein  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  56.32 
 
 		 409 aa  217  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  56.32 
 
 		 409 aa  217  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  56.32 
 
 		 436 aa  217  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  55.79 
 
 		 423 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  43.62 
 
 		 395 aa  171  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  45.21 
 
 		 402 aa  170  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  44.15 
 
 		 417 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  43.09 
 
 		 397 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  42.55 
 
 		 398 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  45.99 
 
 		 413 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  42.55 
 
 		 408 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  45.74 
 
 		 413 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  43.09 
 
 		 410 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  46.67 
 
 		 414 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  46.99 
 
 		 412 aa  160  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  42.11 
 
 		 399 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  40.96 
 
 		 415 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  42.54 
 
 		 413 aa  158  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  45.26 
 
 		 413 aa  157  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  43.32 
 
 		 415 aa  157  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  43.65 
 
 		 416 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  43.72 
 
 		 409 aa  154  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  46.81 
 
 		 415 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  42.78 
 
 		 422 aa  151  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  41.49 
 
 		 403 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  38.83 
 
 		 418 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  42.62 
 
 		 416 aa  148  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  42.62 
 
 		 416 aa  147  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  39.23 
 
 		 418 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  39.89 
 
 		 409 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  38.67 
 
 		 418 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  39.23 
 
 		 419 aa  145  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  42.02 
 
 		 410 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  42.86 
 
 		 413 aa  142  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2895  phage integrase family protein  40.7 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2981  phage integrase family protein  40.12 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.551664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  39.04 
 
 		 418 aa  137  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  39.78 
 
 		 413 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0519  phage integrase  41.81 
 
 		 434 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  40.11 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  36.7 
 
 		 402 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  37.3 
 
 		 411 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  38.83 
 
 		 414 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  37.23 
 
 		 408 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.56 
 
 		 422 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  39.13 
 
 		 404 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  40.11 
 
 		 394 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  38.74 
 
 		 421 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  40.33 
 
 		 419 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  40.11 
 
 		 394 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  38.46 
 
 		 389 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  34.57 
 
 		 404 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  39.78 
 
 		 419 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  35.82 
 
 		 419 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  40 
 
 		 417 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  37.16 
 
 		 391 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  36.96 
 
 		 418 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  36.61 
 
 		 387 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  37.91 
 
 		 397 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  36.9 
 
 		 410 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  35.56 
 
 		 416 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  34.22 
 
 		 449 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0316  phage family integrase  39.57 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  35.87 
 
 		 418 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  32.61 
 
 		 402 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2464  phage integrase  34.44 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.498064  normal  0.0519347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  32.8 
 
 		 404 aa  111  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  33.33 
 
 		 404 aa  111  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  37.1 
 
 		 404 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  34.04 
 
 		 411 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  34.43 
 
 		 400 aa  110  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  34.04 
 
 		 411 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  32.26 
 
 		 404 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.81 
 
 		 420 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  35.52 
 
 		 404 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  38.17 
 
 		 396 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  33.51 
 
 		 411 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  32.6 
 
 		 421 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  34.21 
 
 		 419 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  36.07 
 
 		 419 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  34.81 
 
 		 395 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  33.15 
 
 		 404 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.81 
 
 		 402 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.98 
 
 		 438 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  33.7 
 
 		 419 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  36.07 
 
 		 409 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  37.3 
 
 		 405 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  37.5 
 
 		 396 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  33.7 
 
 		 419 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  34.25 
 
 		 394 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  35.52 
 
 		 413 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3377  phage integrase family protein  35.08 
 
 		 353 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  33.52 
 
 		 420 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  36.22 
 
 		 425 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  32.98 
 
 		 420 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  35.33 
 
 		 425 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  32.6 
 
 		 404 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  33.52 
 
 		 423 aa  104  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  36.76 
 
 		 424 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>