More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1357 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  100 
 
 		 411 aa  857    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  67.34 
 
 		 411 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  66.33 
 
 		 411 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  66.58 
 
 		 411 aa  557  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  55.67 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  54.45 
 
 		 408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  54.03 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  53.06 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  53.69 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  53.33 
 
 		 413 aa  441  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  51.47 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  54.3 
 
 		 416 aa  434  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  50.99 
 
 		 418 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  52.14 
 
 		 409 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  50.87 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  51.64 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  50.99 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  50 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  52.22 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  50.75 
 
 		 413 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  50 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  49.62 
 
 		 409 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  48.85 
 
 		 416 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  49.49 
 
 		 416 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  49.75 
 
 		 410 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  46.27 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  47.81 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  46.51 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  47.94 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  47.1 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  50.63 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  44.61 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  45.19 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  45.85 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  46.11 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  42.32 
 
 		 410 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  43.72 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  42.2 
 
 		 413 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  40 
 
 		 448 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  39.9 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  40.55 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.18 
 
 		 391 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  40.81 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  40.81 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  40.81 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  38.92 
 
 		 404 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  38.48 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  40 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  37.85 
 
 		 394 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  37.85 
 
 		 394 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.56 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  37.31 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  36.6 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  36.18 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  34.59 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  36.18 
 
 		 404 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  36.18 
 
 		 404 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  36.92 
 
 		 417 aa  270  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  35.8 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  35.8 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.95 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  37.95 
 
 		 396 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.95 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  36.71 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  36.62 
 
 		 412 aa  263  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  35.56 
 
 		 421 aa  262  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  36.08 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  37.94 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  36.53 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  33.08 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  36.22 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  35.15 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  36.57 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  35.19 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  34.87 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  33.59 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  36.43 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  36.76 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  33.08 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  36.59 
 
 		 402 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  34.46 
 
 		 410 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  35.79 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  37.88 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  35.77 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  44.68 
 
 		 290 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  35.46 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  33.25 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  36.18 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  38.32 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  35.91 
 
 		 401 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  32.68 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  34.34 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  34.34 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  34.5 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  35.06 
 
 		 411 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  35.82 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  35.49 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  34.51 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  35.7 
 
 		 417 aa  242  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>