More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03468 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03516  Int  100 
 
 		 394 aa  818    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  818    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  79.69 
 
 		 396 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  96.15 
 
 		 417 aa  781    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  72.02 
 
 		 389 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  71.24 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  70.83 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  69.17 
 
 		 391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  65.74 
 
 		 404 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  65.74 
 
 		 404 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  65.74 
 
 		 404 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  61.22 
 
 		 402 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  62.69 
 
 		 394 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  62.94 
 
 		 394 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  62.44 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  63.68 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  63.14 
 
 		 402 aa  527  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  64.25 
 
 		 409 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  61.18 
 
 		 404 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  61.18 
 
 		 404 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  62.4 
 
 		 394 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  61.18 
 
 		 404 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  61.18 
 
 		 404 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  60.86 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  60.36 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  58.67 
 
 		 395 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  61.46 
 
 		 387 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  62.08 
 
 		 367 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  52.82 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  51.28 
 
 		 391 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  48.7 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  48.45 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  46.6 
 
 		 404 aa  381  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  45.05 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  45.92 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  46.08 
 
 		 402 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  46.33 
 
 		 402 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  44.06 
 
 		 421 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  46.68 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  44.42 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  44.06 
 
 		 421 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  43.32 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  44.61 
 
 		 421 aa  352  7e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  43.03 
 
 		 411 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  44.16 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  44.16 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.56 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  44.16 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.33 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  44.1 
 
 		 404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  42.08 
 
 		 420 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  41.83 
 
 		 421 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  45.34 
 
 		 407 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  44.92 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.83 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  45.32 
 
 		 401 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  43.11 
 
 		 438 aa  338  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  42.82 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  45.04 
 
 		 402 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  44.5 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  42.78 
 
 		 411 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  43.88 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  41.73 
 
 		 418 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  43.04 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  44.85 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  43.04 
 
 		 405 aa  328  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  43.26 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  42.47 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  42.72 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  44.42 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  44.2 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  43.39 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  41.73 
 
 		 418 aa  326  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  42.78 
 
 		 404 aa  325  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  41.79 
 
 		 420 aa  319  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  41.48 
 
 		 419 aa  319  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  40 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  43.69 
 
 		 419 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  42.31 
 
 		 401 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  43.4 
 
 		 403 aa  315  9e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  43 
 
 		 412 aa  315  9e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  42.75 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  42.75 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3727  integrase family protein  41.53 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04136  predicted integrase  41.27 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04100  hypothetical protein  41.27 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  42.89 
 
 		 389 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  42.68 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  42.28 
 
 		 404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  40.67 
 
 		 395 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  41.65 
 
 		 421 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  40.93 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  40.93 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  40.29 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  40.29 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  40.53 
 
 		 425 aa  302  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  39.81 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  40.16 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  38.11 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  39.32 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>