More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2887 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  100 
 
 
416 aa  863    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  66.1 
 
 
420 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  66.59 
 
 
421 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  66.34 
 
 
421 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  65.94 
 
 
421 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  64.98 
 
 
419 aa  578  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  66.1 
 
 
420 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  65.62 
 
 
420 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  64.16 
 
 
421 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  65.38 
 
 
411 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  64.01 
 
 
421 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  62.32 
 
 
422 aa  558  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  61.93 
 
 
419 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3727  integrase family protein  63.4 
 
 
396 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04136  predicted integrase  63.14 
 
 
396 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04100  hypothetical protein  63.14 
 
 
396 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  59.13 
 
 
418 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  59.13 
 
 
418 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  58.65 
 
 
419 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  59.95 
 
 
419 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  59.95 
 
 
419 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  54.74 
 
 
425 aa  500  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  54.12 
 
 
425 aa  498  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  54.74 
 
 
428 aa  501  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  56.77 
 
 
424 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  56.77 
 
 
424 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  55.18 
 
 
421 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  54.27 
 
 
425 aa  491  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  53.98 
 
 
419 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  56.49 
 
 
423 aa  484  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  53.49 
 
 
419 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  55.83 
 
 
420 aa  471  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  52.91 
 
 
424 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  55.29 
 
 
423 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  52.43 
 
 
419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  53.61 
 
 
420 aa  467  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  51.94 
 
 
419 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  51.7 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  52.18 
 
 
419 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  51.94 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  52.05 
 
 
449 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4935  integrase family protein  50.96 
 
 
439 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.020057  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3064  Phage integrase  50.84 
 
 
438 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  61.73 
 
 
334 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02760  hypothetical protein  62.2 
 
 
319 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000757589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  44.2 
 
 
394 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  44.2 
 
 
394 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  43.17 
 
 
402 aa  353  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02797  integrase  61.28 
 
 
294 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000596142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  43.03 
 
 
417 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  42.68 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  42.93 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  45.1 
 
 
391 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  42.68 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  43.69 
 
 
404 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  43.69 
 
 
404 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  44.25 
 
 
406 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  43.69 
 
 
404 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  41.77 
 
 
396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  43.2 
 
 
404 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  55.94 
 
 
275 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  39.71 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  39.9 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  40.52 
 
 
412 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  39.66 
 
 
404 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.35 
 
 
394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  39.66 
 
 
404 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  43.51 
 
 
406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  41.36 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.1 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  40.64 
 
 
396 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  40.99 
 
 
409 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  39.05 
 
 
397 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  38.92 
 
 
404 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  39.55 
 
 
387 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  41.12 
 
 
407 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  41 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  40.62 
 
 
413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  42.16 
 
 
403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  40 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  38.56 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  40.58 
 
 
404 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  38.56 
 
 
410 aa  301  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  40 
 
 
403 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  38 
 
 
389 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  39.36 
 
 
395 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  40.1 
 
 
396 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  39.45 
 
 
394 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  39.08 
 
 
404 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.71 
 
 
402 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  40.52 
 
 
407 aa  295  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  39.86 
 
 
411 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  40.45 
 
 
402 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  39.56 
 
 
420 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  40.05 
 
 
421 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  40.96 
 
 
419 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  38.86 
 
 
404 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  39.46 
 
 
400 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  38.75 
 
 
394 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  39.26 
 
 
438 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>