More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2483 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  77.61 
 
 		 462 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  100 
 
 		 404 aa  821    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  79.46 
 
 		 404 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  68.98 
 
 		 404 aa  569  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  65.83 
 
 		 404 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  58.5 
 
 		 405 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  57.43 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  58.25 
 
 		 403 aa  475  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  58.05 
 
 		 413 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  55.58 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  55.05 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  55.34 
 
 		 421 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  76.92 
 
 		 276 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  53.75 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  54.2 
 
 		 403 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  54.95 
 
 		 445 aa  428  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  54.66 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  54.23 
 
 		 406 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  50.48 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  54.28 
 
 		 378 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  52.22 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  50.25 
 
 		 410 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  48.21 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  50.62 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  48.6 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  48.08 
 
 		 428 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  46.06 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  48.88 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  46.75 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  45.65 
 
 		 404 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  47.24 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  45.41 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  45.06 
 
 		 413 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  45.55 
 
 		 391 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  45.87 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  45.65 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  45.65 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  45.57 
 
 		 412 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  46.1 
 
 		 415 aa  328  8e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  41.5 
 
 		 404 aa  322  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  43.17 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  43.7 
 
 		 412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  44.2 
 
 		 404 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  43 
 
 		 402 aa  316  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  40.66 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  44.17 
 
 		 404 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  44.62 
 
 		 409 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  40.4 
 
 		 404 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  40.66 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  41 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  42.54 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  40.75 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  43.86 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  41.04 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  40.75 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.69 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  40.84 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  42.68 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  40.84 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  42.86 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  42.13 
 
 		 396 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  41.89 
 
 		 412 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  43.81 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  41.56 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  40.97 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  42.71 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  41.01 
 
 		 394 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  41.01 
 
 		 394 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  40.71 
 
 		 394 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  41.28 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  43.33 
 
 		 389 aa  292  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  38.85 
 
 		 419 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  42.79 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  40.71 
 
 		 417 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  43.07 
 
 		 401 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  38.61 
 
 		 419 aa  289  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  38.37 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  37.89 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  41.27 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  37.65 
 
 		 419 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  40.21 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  40.05 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  37.89 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  38.61 
 
 		 420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  40.1 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  43.39 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.37 
 
 		 420 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  41.98 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0676  phage integrase family site specific recombinase  49.34 
 
 		 303 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.825642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  38.46 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  39.23 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  37.87 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  38.92 
 
 		 419 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  38.92 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  40.34 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  38.42 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.68 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.42 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  38.02 
 
 		 420 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  37.87 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>