More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0676 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0676  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 303 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.825642  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  57.95 
 
 		 405 aa  362  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  57.28 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  54.61 
 
 		 411 aa  350  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  55.37 
 
 		 421 aa  349  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  56.52 
 
 		 403 aa  349  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  57.81 
 
 		 406 aa  348  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  54.97 
 
 		 403 aa  347  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  56.95 
 
 		 406 aa  345  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  52.84 
 
 		 400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  53.31 
 
 		 404 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  53.53 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  51.67 
 
 		 394 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  54.24 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  48.87 
 
 		 420 aa  305  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  49.36 
 
 		 410 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  49.34 
 
 		 404 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  50.17 
 
 		 445 aa  294  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  50.5 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  48.34 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  49.67 
 
 		 404 aa  291  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  50.99 
 
 		 419 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  48.44 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  50.32 
 
 		 409 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  48.01 
 
 		 462 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  47.57 
 
 		 421 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  48.01 
 
 		 394 aa  277  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  46.69 
 
 		 404 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  48.01 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  46.31 
 
 		 391 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  45.36 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  46.36 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  46.36 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  47.35 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  45.36 
 
 		 404 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  45.03 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  49.19 
 
 		 398 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.69 
 
 		 402 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  45.82 
 
 		 427 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  46.03 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  46.36 
 
 		 367 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  43.71 
 
 		 395 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  44.7 
 
 		 402 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  48.73 
 
 		 276 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  45.86 
 
 		 433 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  46.38 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  44.88 
 
 		 410 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  44.62 
 
 		 428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  45.58 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  47.14 
 
 		 438 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  45.7 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  47.67 
 
 		 404 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  45.51 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  41.39 
 
 		 404 aa  255  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  46.3 
 
 		 413 aa  255  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  42.72 
 
 		 409 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  45.42 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  46.05 
 
 		 396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.75 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  46.49 
 
 		 405 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  45.75 
 
 		 421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  46.53 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  45.42 
 
 		 420 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  43.89 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  44.77 
 
 		 420 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  45.83 
 
 		 403 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  43.71 
 
 		 402 aa  248  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.1 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  44.19 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  44.19 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  46.15 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  44.37 
 
 		 389 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02760  hypothetical protein  45.39 
 
 		 319 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000757589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  42.72 
 
 		 391 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  44.19 
 
 		 404 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  42.32 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  45.07 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  42.32 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  42.72 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  42.81 
 
 		 420 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  42.9 
 
 		 413 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  44.55 
 
 		 415 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  40.79 
 
 		 396 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  42.3 
 
 		 411 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  43.61 
 
 		 393 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  41.64 
 
 		 417 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  46.18 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  41.64 
 
 		 421 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  45.36 
 
 		 412 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  44.34 
 
 		 407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  42.62 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  41.25 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  41.02 
 
 		 402 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  43.23 
 
 		 412 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  40.66 
 
 		 419 aa  232  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  40.85 
 
 		 421 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.98 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  44.26 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  42.16 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  41.95 
 
 		 404 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>