More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3701 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  100 
 
 		 276 aa  557  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  76.92 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  75.82 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  72.16 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  59.34 
 
 		 404 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  58.24 
 
 		 404 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  54.41 
 
 		 413 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  52.38 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  52.38 
 
 		 405 aa  294  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  51.28 
 
 		 403 aa  291  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  49.82 
 
 		 400 aa  288  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  51.14 
 
 		 411 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  50.19 
 
 		 403 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  51.72 
 
 		 406 aa  271  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  48.51 
 
 		 420 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  52.11 
 
 		 406 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  52.09 
 
 		 445 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  47.94 
 
 		 421 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0676  phage integrase family site specific recombinase  48.73 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.825642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  47.99 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  47.01 
 
 		 394 aa  246  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  47.23 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  45.93 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  49.05 
 
 		 405 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  44.06 
 
 		 404 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  44.06 
 
 		 404 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  49.36 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  43.3 
 
 		 404 aa  232  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  44.28 
 
 		 410 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  45.93 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  45.19 
 
 		 404 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  45.19 
 
 		 404 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.98 
 
 		 402 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  46.07 
 
 		 433 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  43.89 
 
 		 391 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  41.57 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  41.38 
 
 		 404 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  47.17 
 
 		 404 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  47.92 
 
 		 409 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  44.83 
 
 		 396 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  44.83 
 
 		 394 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  43.68 
 
 		 367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  43.68 
 
 		 404 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  42.37 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  43.3 
 
 		 404 aa  218  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  43.3 
 
 		 404 aa  218  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  43.3 
 
 		 394 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  43.3 
 
 		 394 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  44.06 
 
 		 417 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  44.61 
 
 		 412 aa  216  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  44.87 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  42.15 
 
 		 409 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  44.24 
 
 		 398 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  42.59 
 
 		 438 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  43.73 
 
 		 396 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  40 
 
 		 427 aa  209  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  42.75 
 
 		 421 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  44.79 
 
 		 413 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  42.7 
 
 		 428 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  44.32 
 
 		 425 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  41.38 
 
 		 397 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  46.9 
 
 		 403 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  42.42 
 
 		 404 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  39.71 
 
 		 402 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  41.76 
 
 		 389 aa  198  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  40.61 
 
 		 410 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1011  integrase  52.6 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  41.06 
 
 		 404 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  41.06 
 
 		 387 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  41.41 
 
 		 412 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  37.4 
 
 		 397 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.84 
 
 		 394 aa  194  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  40.84 
 
 		 396 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  40.3 
 
 		 389 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  44.11 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  43.68 
 
 		 415 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.46 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  40.68 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  38.78 
 
 		 396 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  44.94 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  38.49 
 
 		 407 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3377  phage integrase family protein  39.18 
 
 		 353 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  39.08 
 
 		 387 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  38.93 
 
 		 402 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  38.31 
 
 		 420 aa  188  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  39.08 
 
 		 411 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  43.13 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  40.84 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.16 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  39.46 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  39.46 
 
 		 419 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.55 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  42.53 
 
 		 403 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  37.93 
 
 		 420 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  34.94 
 
 		 402 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  37.55 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  39.08 
 
 		 419 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  38.17 
 
 		 421 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.16 
 
 		 421 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  39.62 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>