More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1011 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1011  integrase  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  74.18 
 
 		 404 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  73.24 
 
 		 404 aa  320  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  73.24 
 
 		 404 aa  320  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  73.24 
 
 		 404 aa  318  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  69.52 
 
 		 438 aa  305  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  70.89 
 
 		 404 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  55.3 
 
 		 413 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  54.03 
 
 		 391 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  53.92 
 
 		 404 aa  228  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  55.44 
 
 		 405 aa  221  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  53.89 
 
 		 407 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  52.6 
 
 		 404 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  52.6 
 
 		 407 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  51.56 
 
 		 394 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  51.56 
 
 		 394 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  51.56 
 
 		 404 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  51.04 
 
 		 417 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  47.49 
 
 		 403 aa  198  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  52.6 
 
 		 276 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  51.04 
 
 		 406 aa  197  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  50.72 
 
 		 401 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  44.09 
 
 		 395 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  45.83 
 
 		 402 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  46.79 
 
 		 404 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  46.38 
 
 		 396 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.38 
 
 		 394 aa  191  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  45.83 
 
 		 404 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  45.31 
 
 		 404 aa  191  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  46.35 
 
 		 404 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.41 
 
 		 394 aa  189  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  48.44 
 
 		 404 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  45.89 
 
 		 396 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  43.75 
 
 		 404 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  47.92 
 
 		 404 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  47.92 
 
 		 404 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  48.96 
 
 		 406 aa  187  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  47.94 
 
 		 402 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  48.4 
 
 		 462 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  45.79 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  47.94 
 
 		 394 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  50.26 
 
 		 425 aa  185  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  47.21 
 
 		 367 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  47.95 
 
 		 445 aa  185  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  46.97 
 
 		 404 aa  184  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  45 
 
 		 403 aa  184  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  43.78 
 
 		 400 aa  184  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  48.96 
 
 		 334 aa  184  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  47.92 
 
 		 396 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  48.96 
 
 		 420 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  48.96 
 
 		 421 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  48.96 
 
 		 420 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02760  hypothetical protein  48.96 
 
 		 319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000757589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  49.22 
 
 		 421 aa  181  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  47.94 
 
 		 396 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  45.83 
 
 		 387 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  45.31 
 
 		 391 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  48.44 
 
 		 421 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  44.44 
 
 		 409 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  49.48 
 
 		 413 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  46.36 
 
 		 419 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  44.79 
 
 		 389 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  46.88 
 
 		 411 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  45.37 
 
 		 427 aa  175  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  45.55 
 
 		 414 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  45.45 
 
 		 410 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  45.08 
 
 		 420 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  43.75 
 
 		 397 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  46.67 
 
 		 411 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  48.19 
 
 		 422 aa  171  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  46.35 
 
 		 419 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  46.35 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  47.67 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  46.88 
 
 		 421 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  46.88 
 
 		 420 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  44.06 
 
 		 429 aa  168  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  47.4 
 
 		 419 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  44.27 
 
 		 419 aa  168  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0676  phage integrase family site specific recombinase  49.48 
 
 		 303 aa  168  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.825642  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2014  phage integrase  47.37 
 
 		 416 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  44.27 
 
 		 419 aa  167  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  45.31 
 
 		 421 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  43.12 
 
 		 407 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  39.69 
 
 		 410 aa  161  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  39.66 
 
 		 428 aa  161  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  43.24 
 
 		 412 aa  161  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  40.65 
 
 		 428 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  43.23 
 
 		 421 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  38.68 
 
 		 401 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  46.95 
 
 		 412 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  37.62 
 
 		 402 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02797  integrase  48.5 
 
 		 294 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000596142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  39.72 
 
 		 425 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  40.19 
 
 		 425 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  45.83 
 
 		 416 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  42.78 
 
 		 401 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  43.44 
 
 		 417 aa  155  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  42.35 
 
 		 424 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2310  hypothetical protein  43.16 
 
 		 268 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  39.56 
 
 		 433 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>