More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3853 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  99.75 
 
 		 404 aa  839    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  99.75 
 
 		 404 aa  839    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 404 aa  840    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  72.52 
 
 		 404 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  65.74 
 
 		 394 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  65.74 
 
 		 394 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  65.55 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  64.62 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  72.19 
 
 		 367 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  63.68 
 
 		 402 aa  534  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  62.18 
 
 		 396 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  62.18 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  61.93 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  63.2 
 
 		 394 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  60.93 
 
 		 402 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  59.8 
 
 		 404 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  60.31 
 
 		 404 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  60.31 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  62.15 
 
 		 396 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  62.18 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  59.07 
 
 		 410 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  59.64 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  57.33 
 
 		 395 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  58.55 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  58.81 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  57.77 
 
 		 391 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  57.36 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  58.59 
 
 		 387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  51.41 
 
 		 401 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  46.94 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  47.24 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  46.6 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  45.61 
 
 		 406 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  44.05 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  47.54 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  44.3 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  44.04 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  42.11 
 
 		 404 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  44.22 
 
 		 401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  42.61 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  42.61 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  44.09 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  44.86 
 
 		 406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  43.53 
 
 		 411 aa  338  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  42.5 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  40.51 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  42.36 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  43.6 
 
 		 413 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  44.33 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  43.25 
 
 		 405 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  42.82 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  44.33 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  43.63 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  42.57 
 
 		 420 aa  332  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  42.6 
 
 		 438 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  42.44 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  43.28 
 
 		 407 aa  329  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  42.75 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  42.68 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  43.86 
 
 		 404 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  43.88 
 
 		 403 aa  325  6e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  42.56 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  41.83 
 
 		 412 aa  321  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  42.25 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  41.83 
 
 		 421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  42.08 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  41.54 
 
 		 411 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  41.58 
 
 		 419 aa  319  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  40.84 
 
 		 421 aa  318  9e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  42.36 
 
 		 419 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  42.36 
 
 		 419 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  40.81 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  41.5 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.34 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  42.43 
 
 		 410 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  41.09 
 
 		 421 aa  315  9e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.84 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.34 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  39.85 
 
 		 393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  41.77 
 
 		 419 aa  312  5.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  41 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  41.77 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  42.28 
 
 		 378 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  43.03 
 
 		 409 aa  308  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  40 
 
 		 418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  42.38 
 
 		 389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  42.89 
 
 		 401 aa  305  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  38.31 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  41.63 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  40.67 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  40 
 
 		 418 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  39.5 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  40.59 
 
 		 419 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  40 
 
 		 449 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  42.09 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  40.93 
 
 		 395 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  40.19 
 
 		 425 aa  298  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  40.49 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  39.85 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  42.21 
 
 		 405 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>