More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2895 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2895  phage integrase family protein  100 
 
 		 176 aa  356  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2981  phage integrase family protein  97.16 
 
 		 176 aa  349  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.551664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  95.29 
 
 		 399 aa  333  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0316  phage family integrase  89.1 
 
 		 160 aa  278  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0136682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  75.29 
 
 		 403 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  68.82 
 
 		 402 aa  253  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  63.53 
 
 		 398 aa  236  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  64.71 
 
 		 397 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  60.59 
 
 		 395 aa  221  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  47.65 
 
 		 413 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  51.46 
 
 		 416 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  48.54 
 
 		 409 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  48.54 
 
 		 416 aa  160  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  46.86 
 
 		 423 aa  160  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  45.03 
 
 		 413 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  45.14 
 
 		 409 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  45.14 
 
 		 409 aa  154  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  45.14 
 
 		 436 aa  154  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  42.94 
 
 		 415 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  45.88 
 
 		 413 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  39.41 
 
 		 410 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  40 
 
 		 413 aa  144  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  42.94 
 
 		 417 aa  144  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  42.35 
 
 		 414 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  38.82 
 
 		 408 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2883  phage integrase family protein  40.7 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  38.24 
 
 		 409 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  39.41 
 
 		 415 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  40.35 
 
 		 416 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  40.49 
 
 		 418 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  37.65 
 
 		 418 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  37.65 
 
 		 422 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  37.65 
 
 		 418 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  40.35 
 
 		 415 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  43.02 
 
 		 421 aa  127  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  37.28 
 
 		 419 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  40.74 
 
 		 409 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  37.06 
 
 		 410 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  35.29 
 
 		 420 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  37.87 
 
 		 416 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  36.14 
 
 		 412 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  39.26 
 
 		 410 aa  120  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  36.81 
 
 		 404 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  36.47 
 
 		 404 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  40.74 
 
 		 396 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  40.13 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  38.82 
 
 		 413 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  38.82 
 
 		 419 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  39.02 
 
 		 389 aa  117  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2464  phage integrase  33.33 
 
 		 216 aa  117  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.498064  normal  0.0519347 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0519  phage integrase  40.23 
 
 		 434 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  38.89 
 
 		 394 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  38.89 
 
 		 394 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  37.65 
 
 		 414 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  38.27 
 
 		 404 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  37.2 
 
 		 406 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  38.27 
 
 		 417 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  37.42 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1011  integrase  37.2 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  35.29 
 
 		 408 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  40.24 
 
 		 404 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  35.98 
 
 		 404 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4935  integrase family protein  36.05 
 
 		 439 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.020057  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3064  Phage integrase  34.3 
 
 		 438 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  36.63 
 
 		 403 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  35.56 
 
 		 410 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  34.71 
 
 		 402 aa  108  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  37.95 
 
 		 396 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  37.35 
 
 		 391 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  36.59 
 
 		 417 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  34.76 
 
 		 404 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  34.76 
 
 		 404 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  36.47 
 
 		 411 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  35.98 
 
 		 413 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  36.47 
 
 		 411 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  36.47 
 
 		 411 aa  104  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  36.75 
 
 		 387 aa  104  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  33.53 
 
 		 438 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  34.76 
 
 		 404 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  33.95 
 
 		 402 aa  104  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  38.04 
 
 		 400 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  34.27 
 
 		 418 aa  103  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.65 
 
 		 422 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  33.74 
 
 		 412 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  37.8 
 
 		 403 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  38.65 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  36.2 
 
 		 418 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  36.53 
 
 		 411 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  39.05 
 
 		 412 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  37.2 
 
 		 396 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  35.36 
 
 		 419 aa  101  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  36.42 
 
 		 394 aa  101  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  32.52 
 
 		 404 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  35.58 
 
 		 397 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  35.37 
 
 		 428 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  33.95 
 
 		 395 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  36.75 
 
 		 419 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.04 
 
 		 402 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  38.04 
 
 		 487 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  35.58 
 
 		 418 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>