More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2464 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2464  phage integrase  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.498064  normal  0.0519347 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  39.9 
 
 		 416 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  36.55 
 
 		 408 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  37.5 
 
 		 413 aa  154  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  38.31 
 
 		 415 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  37.69 
 
 		 408 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  36.82 
 
 		 422 aa  151  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  37.19 
 
 		 412 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  36.5 
 
 		 395 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  37.5 
 
 		 416 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  36.63 
 
 		 414 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  37.69 
 
 		 414 aa  147  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  37.82 
 
 		 415 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  36 
 
 		 413 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  37.06 
 
 		 402 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  36.22 
 
 		 419 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  34.16 
 
 		 415 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  35.47 
 
 		 416 aa  141  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  35.75 
 
 		 413 aa  141  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  36.98 
 
 		 418 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  36.73 
 
 		 416 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  36.14 
 
 		 409 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  35.96 
 
 		 398 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  34 
 
 		 397 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  35.32 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  35.03 
 
 		 417 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  34.2 
 
 		 413 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  35.05 
 
 		 410 aa  134  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  31.16 
 
 		 409 aa  134  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  32.83 
 
 		 418 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  36.14 
 
 		 410 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  37.13 
 
 		 409 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  37.13 
 
 		 409 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  36.62 
 
 		 423 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  37.13 
 
 		 436 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  36.13 
 
 		 413 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  32 
 
 		 399 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.16 
 
 		 422 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  31.98 
 
 		 275 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  31.44 
 
 		 418 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  31.66 
 
 		 391 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3064  Phage integrase  34.72 
 
 		 438 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2895  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2981  phage integrase family protein  32.14 
 
 		 176 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.551664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  32.32 
 
 		 401 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  29.95 
 
 		 419 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  29.95 
 
 		 419 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2883  phage integrase family protein  34.44 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4935  integrase family protein  32.84 
 
 		 439 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.020057  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 393 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  31.66 
 
 		 421 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.82 
 
 		 394 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  31.82 
 
 		 396 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  32.32 
 
 		 421 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  32.34 
 
 		 420 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  33.16 
 
 		 411 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.31 
 
 		 394 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  35.23 
 
 		 413 aa  108  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  29.95 
 
 		 411 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  33.5 
 
 		 418 aa  108  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  31.31 
 
 		 418 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  31.98 
 
 		 423 aa  107  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  29.95 
 
 		 391 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  28.22 
 
 		 404 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  33.79 
 
 		 449 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  32.83 
 
 		 425 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  32.11 
 
 		 425 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0519  phage integrase  38.22 
 
 		 434 aa  105  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  30.81 
 
 		 418 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  30.81 
 
 		 410 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  29.95 
 
 		 421 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  31.31 
 
 		 411 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 402 aa  105  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  30.46 
 
 		 419 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  30.3 
 
 		 394 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 411 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  30.85 
 
 		 421 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  32.02 
 
 		 419 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 411 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  26.26 
 
 		 404 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  28.85 
 
 		 417 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  30.85 
 
 		 427 aa  101  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.8 
 
 		 402 aa  101  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  31.82 
 
 		 425 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  28.64 
 
 		 400 aa  101  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  30.96 
 
 		 401 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  31.82 
 
 		 428 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  29.29 
 
 		 394 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  28.28 
 
 		 397 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  30.46 
 
 		 423 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  29.29 
 
 		 394 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  31.68 
 
 		 419 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  28.92 
 
 		 421 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 419 aa  99.4  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  29.59 
 
 		 409 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  31.68 
 
 		 419 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  27.27 
 
 		 402 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  31.63 
 
 		 404 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  28.85 
 
 		 429 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  31.84 
 
 		 424 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>