More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0451 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0451  integrase family protein  100 
 
 		 416 aa  863    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53579  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1459  putative prophage integrase  33.66 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000102793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  30.1 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  31.83 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  30.9 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  30.79 
 
 		 402 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  28.89 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  29.06 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  30.62 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  28.18 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  28.82 
 
 		 404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 398 aa  166  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  29.56 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  29.38 
 
 		 422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  27.72 
 
 		 413 aa  163  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  29.29 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  28.46 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  28.15 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  27.65 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  29.98 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  29.45 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  28.33 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  27.39 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  29.9 
 
 		 406 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  29.5 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  29.33 
 
 		 421 aa  159  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  27.59 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  28.86 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  29.48 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 416 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  29.63 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  28.29 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  28.29 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.81 
 
 		 420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  28.71 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  28.68 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  27.34 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  28.12 
 
 		 415 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  27.14 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  29.1 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  27.59 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  28.82 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  29.33 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  27.34 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  27.56 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  28.22 
 
 		 404 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  28.19 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  27.71 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  26.24 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  28.92 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.85 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  27.43 
 
 		 396 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  28.5 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  28.08 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  26.41 
 
 		 420 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  28.57 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  27.99 
 
 		 421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  28.33 
 
 		 403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  27.3 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  27.83 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.27 
 
 		 422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  28.89 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  27.3 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3064  Phage integrase  27.38 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  27.61 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  28.36 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  26.93 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  28.01 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  28.26 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  25.79 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  28.26 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  27.5 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 423 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  27.29 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  26.3 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  27.34 
 
 		 423 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  26.91 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  24.75 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  27.05 
 
 		 424 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 411 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 411 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  28.78 
 
 		 404 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  27.34 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  27.05 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  27.75 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  27.05 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  29.31 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  27.34 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>