More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2541 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  100 
 
 		 412 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  38.69 
 
 		 406 aa  259  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  36.32 
 
 		 420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  38.12 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  34.79 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  37.23 
 
 		 421 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  37.06 
 
 		 406 aa  242  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  35.75 
 
 		 419 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  37.96 
 
 		 401 aa  239  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  35.26 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  34.51 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  36.63 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  37.63 
 
 		 429 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  34.7 
 
 		 402 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  36.21 
 
 		 421 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  36.82 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  36.52 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  36.41 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  37 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  36.32 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  33.17 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  35.41 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  36.36 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  35.61 
 
 		 445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  32.58 
 
 		 422 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  35.66 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  31.42 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  34.37 
 
 		 390 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  35.75 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  35.44 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  37.84 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  31.83 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  34.32 
 
 		 407 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  34.17 
 
 		 438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  33.76 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  32.66 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  32.73 
 
 		 410 aa  216  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  36.46 
 
 		 415 aa  216  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  35.44 
 
 		 404 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  35.44 
 
 		 404 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  32.1 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  34.02 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  34.86 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  34.72 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  33.17 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  34.02 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  33.94 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  33.42 
 
 		 462 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  35.12 
 
 		 404 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  37.25 
 
 		 433 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  32.36 
 
 		 416 aa  212  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  32.25 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  32.04 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  31.13 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  34.43 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  33.59 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  33.5 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  34.55 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  36.34 
 
 		 409 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  33.25 
 
 		 404 aa  209  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  33.25 
 
 		 404 aa  209  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  32.82 
 
 		 418 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  35.05 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  32.57 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  31.51 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  36.32 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  32.07 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  33.16 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  36.39 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  31.54 
 
 		 414 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  33.16 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  33.75 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  32.41 
 
 		 419 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  33.49 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  33 
 
 		 408 aa  206  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  33.66 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  32.99 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  31.14 
 
 		 413 aa  203  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  32.56 
 
 		 396 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  31.5 
 
 		 413 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.58 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  32.07 
 
 		 403 aa  202  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  35.43 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  33.58 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  31.7 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  33.01 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  31.44 
 
 		 418 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  31.71 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  31.55 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  31.67 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  35.75 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2014  phage integrase  32.02 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  30.38 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  29.95 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  33.57 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  33.33 
 
 		 421 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  32.4 
 
 		 414 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  33.58 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  31.28 
 
 		 397 aa  199  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>