More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1101 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  100 
 
 		 399 aa  816    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  43.48 
 
 		 396 aa  338  7e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  34.31 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  29.65 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  33.83 
 
 		 396 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  32.76 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  31.11 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  30.27 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  29.93 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  30.08 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  29.57 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.89 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  30.25 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  28.46 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  28.89 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  31.63 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  28.46 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  30.08 
 
 		 409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  30.33 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  30.08 
 
 		 409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  30.08 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  28.21 
 
 		 404 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  29.56 
 
 		 394 aa  189  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  29.95 
 
 		 410 aa  189  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  29.63 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  30.62 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  30.15 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  29.95 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  31.06 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  29.9 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  29.9 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  30.25 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  30.56 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  29.15 
 
 		 406 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  29.19 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  30.15 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  30.2 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  31.14 
 
 		 409 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  29.47 
 
 		 406 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  28.93 
 
 		 391 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  29.19 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  29.75 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  30.35 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  29.75 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  31.68 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1418  phage integrase family site specific recombinase  33.76 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.239727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  29.29 
 
 		 411 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.65 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.65 
 
 		 394 aa  179  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.72 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  29.93 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  29.47 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  29.02 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0824  site-specific recombinase, phage integrase family  33.25 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.966036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  28.07 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  29.28 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  29.06 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  30.13 
 
 		 404 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  29.06 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  26.95 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  29.73 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  30.17 
 
 		 415 aa  176  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  30.23 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  29.47 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  29.11 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  27.92 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  29.66 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  28.89 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  26.7 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  29.48 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  29.98 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  27.76 
 
 		 420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  30.64 
 
 		 419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  29.58 
 
 		 428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  27.78 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  26.7 
 
 		 445 aa  173  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  28.25 
 
 		 393 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  30.64 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  29.63 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  28.12 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 416 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  28.97 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  27.52 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  27.76 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  27.56 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  29.34 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  27.8 
 
 		 419 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  28.68 
 
 		 419 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  29.66 
 
 		 423 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.03 
 
 		 420 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  30.19 
 
 		 378 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  28.21 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  26.45 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>