More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0824 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0824  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 392 aa  800    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.966036  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1418  phage integrase family site specific recombinase  76.61 
 
 		 391 aa  616  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.239727  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  33.83 
 
 		 396 aa  185  9e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  33.25 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  32.35 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  35.38 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  34.03 
 
 		 409 aa  172  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  29.76 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  31.85 
 
 		 416 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1711  phage integrase family site specific recombinase  33.66 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.109481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  30.05 
 
 		 415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  31.81 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  30.75 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  32.37 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  30.91 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  30.41 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  30.13 
 
 		 408 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  31.12 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  29.54 
 
 		 415 aa  159  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  31.21 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  31.03 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  31.23 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  31.46 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  30.87 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  29.97 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  29.64 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  31.26 
 
 		 409 aa  155  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  29.58 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  32.08 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 395 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  29.23 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  27.82 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  29.52 
 
 		 418 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  27.07 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  29.46 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  30 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  31.23 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  26.98 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  28.78 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  27.18 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  27.82 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  29.02 
 
 		 419 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  27.56 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  27.56 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  28.85 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 416 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  25.5 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  29.85 
 
 		 409 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  29.85 
 
 		 436 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  29.85 
 
 		 409 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0544  phage integrase family site specific recombinase  30.62 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  28.08 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0292  phage integrase family site specific recombinase  30.12 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  28.54 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0315  30S ribosomal protein S15  27.49 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00992142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  29.78 
 
 		 429 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  29.05 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.61 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  28.04 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  28.34 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  27.15 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  26.93 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  27.18 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  29.82 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  29 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  27.69 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  28.83 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  27.23 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  27.13 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  26.46 
 
 		 438 aa  136  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  26.57 
 
 		 404 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.54 
 
 		 394 aa  135  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.53 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  26.32 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  28.12 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.5 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  29.13 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  27.52 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  27.47 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  26.24 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  28.26 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  25.8 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  29.1 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  25.19 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  28.47 
 
 		 402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  27.97 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  26.8 
 
 		 404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  26.91 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  29.1 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  26.91 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  28.38 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  27.38 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>