More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6107 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  100 
 
 
410 aa  838    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.69 
 
 
404 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  43.54 
 
 
404 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  42.62 
 
 
405 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  37.94 
 
 
443 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  37.05 
 
 
447 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  37.59 
 
 
429 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  40.2 
 
 
414 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  40 
 
 
421 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  40 
 
 
421 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  40 
 
 
421 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  39.74 
 
 
426 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  39.74 
 
 
421 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  39.74 
 
 
421 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  39.74 
 
 
421 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  36.01 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  34.75 
 
 
432 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  33.58 
 
 
434 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  36.02 
 
 
433 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  35.77 
 
 
433 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  35.77 
 
 
433 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  33.73 
 
 
415 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  35.99 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  35.99 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  35.73 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  33.99 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  35.73 
 
 
434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  34.15 
 
 
436 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  33.42 
 
 
434 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  29.46 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  29.46 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  29.85 
 
 
438 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  29.85 
 
 
438 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  29.85 
 
 
438 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  29.85 
 
 
438 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  29.85 
 
 
438 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  29.85 
 
 
438 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  29.85 
 
 
438 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  30.35 
 
 
437 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  31.81 
 
 
449 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  29.92 
 
 
453 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  32.06 
 
 
449 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  29.76 
 
 
440 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  30.38 
 
 
430 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  28.43 
 
 
460 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  28.68 
 
 
413 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  29.9 
 
 
460 aa  143  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  29.35 
 
 
406 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  27.99 
 
 
452 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  25.99 
 
 
443 aa  136  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.43 
 
 
442 aa  133  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  25.31 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  28.84 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  24.94 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  28.68 
 
 
278 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  23.1 
 
 
429 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  28.91 
 
 
463 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1672  OmpA/MotB domain protein  27.07 
 
 
431 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  27.38 
 
 
438 aa  96.3  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4998  OmpA/MotB  48.11 
 
 
119 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  26.26 
 
 
487 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5862  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
103 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1824  hypothetical protein  36.3 
 
 
308 aa  89.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  24.94 
 
 
536 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  25.26 
 
 
536 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  24.94 
 
 
535 aa  87.4  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  36.99 
 
 
313 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  27.75 
 
 
594 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  37.04 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  36.92 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  26.12 
 
 
493 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  27.76 
 
 
552 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  27.76 
 
 
571 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  27.76 
 
 
552 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  27.76 
 
 
560 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  27.76 
 
 
552 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  27.76 
 
 
552 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  27.76 
 
 
571 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  34.03 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  31.25 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  31.25 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  31.25 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25.94 
 
 
494 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  31.94 
 
 
310 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  31.94 
 
 
310 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  31.94 
 
 
310 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  31.94 
 
 
310 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  31.94 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
322 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  31.25 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  31.94 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  33.54 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2000  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297177  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  32.21 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  33.1 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  32.19 
 
 
314 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  31.25 
 
 
322 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  32.39 
 
 
271 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  32.64 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>