More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2000 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2000  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 167 aa  330  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1672  OmpA/MotB domain protein  60.95 
 
 		 431 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303989 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  41.61 
 
 		 436 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  39.26 
 
 		 415 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  40.88 
 
 		 421 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  40.88 
 
 		 421 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  40.88 
 
 		 421 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  40.88 
 
 		 426 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  40.88 
 
 		 421 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  40.88 
 
 		 421 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  40.88 
 
 		 421 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  41.54 
 
 		 431 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  38.57 
 
 		 430 aa  91.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 		 246 aa  91.7  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  39.39 
 
 		 443 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  43.64 
 
 		 432 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 272 aa  88.2  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  39.42 
 
 		 434 aa  87.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  42.64 
 
 		 221 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  42.73 
 
 		 434 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  39.39 
 
 		 414 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  39.39 
 
 		 242 aa  84.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  37.71 
 
 		 299 aa  84.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  38.64 
 
 		 447 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  35.71 
 
 		 330 aa  84  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  46.55 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  38.52 
 
 		 433 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  38.52 
 
 		 433 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  36.49 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  35.33 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  38.4 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  38.52 
 
 		 433 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  38.46 
 
 		 429 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  45.22 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  40.85 
 
 		 440 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  39.16 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  39.16 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  39.16 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  35.92 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  39.16 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  38.41 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  39.16 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  39.16 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  39.16 
 
 		 438 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  39.42 
 
 		 453 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  34.23 
 
 		 338 aa  78.2  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  41.67 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 222 aa  77.4  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  38.89 
 
 		 430 aa  77.4  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  33.75 
 
 		 286 aa  77.4  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  43.81 
 
 		 329 aa  77.4  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  34.29 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.76 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  38.89 
 
 		 535 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.33 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  35.26 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  38.89 
 
 		 536 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  36.17 
 
 		 452 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  38.89 
 
 		 536 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  32.65 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  34.67 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  39.1 
 
 		 429 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  51.32 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  47.31 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  35.77 
 
 		 434 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  39.13 
 
 		 437 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  35.77 
 
 		 434 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  35.77 
 
 		 434 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  52.63 
 
 		 209 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.86 
 
 		 220 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  43.36 
 
 		 283 aa  74.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 		 224 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  37.72 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  34.56 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  51.32 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  35.04 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  38.69 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  34.56 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  39.42 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  36.55 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  37.96 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  33.78 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  40.34 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  38.02 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  43.86 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  37.09 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  29.93 
 
 		 458 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  37.32 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  34.81 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>