More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0231 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  100 
 
 		 366 aa  723    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  99.73 
 
 		 366 aa  722    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  83.42 
 
 		 367 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  27.86 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  27.84 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  44.37 
 
 		 294 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  41.1 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  37.67 
 
 		 258 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 		 271 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  42.64 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  40.14 
 
 		 282 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  35 
 
 		 249 aa  96.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  35.52 
 
 		 257 aa  96.7  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 267 aa  96.3  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  28.12 
 
 		 266 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 275 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  36.69 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  35.81 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  39.13 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  39.06 
 
 		 254 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 253 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  32.14 
 
 		 259 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  40.32 
 
 		 321 aa  93.2  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  38.73 
 
 		 179 aa  93.2  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  40.8 
 
 		 280 aa  92.8  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  40.14 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.62 
 
 		 263 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  35.77 
 
 		 309 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  40.8 
 
 		 286 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  30.19 
 
 		 236 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  40.8 
 
 		 285 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  38.93 
 
 		 273 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  38.93 
 
 		 273 aa  90.5  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  34.25 
 
 		 267 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  39.86 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  35.33 
 
 		 251 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  39.44 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  35.18 
 
 		 269 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  32.85 
 
 		 315 aa  89.7  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  42.06 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  36.96 
 
 		 289 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  31.72 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  38.13 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  32.85 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  34.75 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  30.43 
 
 		 322 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  43.59 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  38.3 
 
 		 434 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  38.41 
 
 		 430 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  33.54 
 
 		 329 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  37.14 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  28.87 
 
 		 280 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  41.53 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1593  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 		 290 aa  87.8  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.907299  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  32.61 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  34.38 
 
 		 245 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 288 aa  87.4  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  31.61 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  39.2 
 
 		 305 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  39.44 
 
 		 447 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  39.01 
 
 		 296 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  34.75 
 
 		 458 aa  86.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  39.57 
 
 		 291 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  38.3 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  34.75 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  29.94 
 
 		 265 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  37.32 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.06 
 
 		 277 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  37.96 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  36.62 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  37.75 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  35.97 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  34.75 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  36.62 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  36.62 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  36.43 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  35.92 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  36.43 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  42.68 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  36.43 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  36.43 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  31.16 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  28.49 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  37.12 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  30.57 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  30.57 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  30.43 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  30.43 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  30.43 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  31.16 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  30.43 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  30.43 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  38.46 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  42.74 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>