More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1593 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1593  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
290 aa  590  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.907299  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  63.03 
 
 
286 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2921  OmpA/MotB domain-containing protein  61.4 
 
 
277 aa  338  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  49.12 
 
 
285 aa  271  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 
294 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2377  OmpA/MotB domain protein  41.87 
 
 
295 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447675  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11308  putative flagellar motor protein MotB  40.91 
 
 
280 aa  205  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.890951  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  30.94 
 
 
321 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  30.79 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  34.85 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  31.23 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  28.28 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  40.28 
 
 
275 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  35.47 
 
 
251 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  42.02 
 
 
179 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  39.67 
 
 
249 aa  99.4  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  38.73 
 
 
257 aa  99  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  26.45 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  37.68 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  39.86 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  43.59 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  36.81 
 
 
267 aa  92  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  40.65 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  30.73 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  41.32 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  39.37 
 
 
252 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  37.68 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  37.84 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  34.17 
 
 
236 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  35.68 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  31.94 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  35.63 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 
238 aa  89.4  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.77 
 
 
263 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  31.21 
 
 
258 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  24.19 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  29.57 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  37.82 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  35.29 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  34.76 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  38.4 
 
 
366 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  36.92 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  38.4 
 
 
367 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  38.4 
 
 
366 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
290 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 
223 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  27.64 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  35.61 
 
 
275 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  42.98 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  39.85 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  39.85 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 
271 aa  86.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  35.06 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  38.02 
 
 
267 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
254 aa  85.9  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 
305 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  43.1 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  39.29 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  36.22 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  37.4 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  36.22 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  31.43 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  33.61 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  34.03 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  36.05 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  35.37 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  37.7 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
228 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  33.59 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  34.88 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  34.48 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  34.71 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  38.6 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  30.95 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  30 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  31.43 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  33.61 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  36.84 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  37.93 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  32.79 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  32.79 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  32.79 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  32.79 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  32.79 
 
 
262 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>