More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1395 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
367 aa  726    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  84.32 
 
 
366 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  84.59 
 
 
366 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  28.53 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  27.94 
 
 
325 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  26.38 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  43.97 
 
 
294 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
275 aa  99.8  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  41.55 
 
 
282 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  32.47 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  38.58 
 
 
321 aa  93.2  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  35.46 
 
 
288 aa  92.8  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  27.57 
 
 
266 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  33.53 
 
 
271 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  34.25 
 
 
258 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
280 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  37.86 
 
 
434 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  37.59 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  30.96 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  31.78 
 
 
259 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2377  OmpA/MotB domain protein  37.58 
 
 
295 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447675  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  37.86 
 
 
434 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  37.86 
 
 
434 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  37.14 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  34.44 
 
 
267 aa  90.1  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  40.31 
 
 
263 aa  89.7  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  45.12 
 
 
309 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 
254 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  37.86 
 
 
434 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  35.04 
 
 
309 aa  89.4  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  38.62 
 
 
179 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  28.94 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  27.57 
 
 
271 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  29.71 
 
 
322 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1593  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.907299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
253 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  31.88 
 
 
286 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  38.82 
 
 
256 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  36.99 
 
 
266 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  33.12 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  38.73 
 
 
415 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  37.68 
 
 
430 aa  86.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  36.3 
 
 
257 aa  86.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  32.12 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  33.75 
 
 
259 aa  86.3  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  48.72 
 
 
308 aa  86.3  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  37.18 
 
 
291 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  40.88 
 
 
252 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  40.8 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  48.05 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  48.05 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  48.05 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  46.75 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  37.68 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  29.9 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  30.43 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  46.75 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  33.81 
 
 
287 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  37.4 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  40.62 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  34.15 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  37.14 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  37.4 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  48.05 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  31.61 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  46.75 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  30.66 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  46.75 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  37.14 
 
 
433 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  37.14 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  37.14 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  35 
 
 
296 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  46.75 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  41.59 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.11 
 
 
263 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  46.75 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  34.53 
 
 
431 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  46.75 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  37.68 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  37.68 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  37.68 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  37.68 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  37.68 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  37.68 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  37.68 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  34.53 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  39.06 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  34.78 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  32.33 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  36.43 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  34.09 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  39.42 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  33.33 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  42.52 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  35.71 
 
 
433 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>