More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0325 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
280 aa  564  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  40.06 
 
 
323 aa  206  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  37.26 
 
 
321 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  34.98 
 
 
314 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  36.24 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2921  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 
277 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2377  OmpA/MotB domain protein  37.68 
 
 
295 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447675  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  32.3 
 
 
294 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1593  OmpA/MotB domain protein  31.36 
 
 
290 aa  135  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.907299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  31.93 
 
 
285 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  36.55 
 
 
266 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  31.52 
 
 
282 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11308  putative flagellar motor protein MotB  29.55 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.890951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  28.67 
 
 
292 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  31.76 
 
 
287 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  30.96 
 
 
289 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  36.53 
 
 
248 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  32.34 
 
 
525 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  31.6 
 
 
343 aa  99.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  43.48 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  38.19 
 
 
238 aa  99.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  30.56 
 
 
784 aa  99.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  31.6 
 
 
343 aa  98.6  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  42.98 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  32.64 
 
 
525 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  38.06 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  32.5 
 
 
525 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  35.33 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  42.5 
 
 
343 aa  96.3  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  27.98 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  31.3 
 
 
648 aa  95.9  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  39.23 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  40.5 
 
 
343 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  38.13 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  34.66 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  38.52 
 
 
179 aa  94  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  39.85 
 
 
267 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  39.72 
 
 
366 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  39.72 
 
 
366 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  41.32 
 
 
343 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  40.5 
 
 
314 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  40 
 
 
244 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
367 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  35.57 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  28.62 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 
257 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  29.06 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  33.77 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.23 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  31.18 
 
 
338 aa  89  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  32.95 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  33.52 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 
342 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  35.77 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  33.68 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
269 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  32.89 
 
 
267 aa  87  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  37.24 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  35.26 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 
248 aa  85.9  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  37.8 
 
 
281 aa  85.5  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  41.32 
 
 
343 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  33.85 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  27.86 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  35.86 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  32.07 
 
 
375 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  34.11 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  30.67 
 
 
225 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  40.65 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  31.65 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  29.75 
 
 
799 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  36.15 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  34.93 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  42.28 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  39.02 
 
 
285 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  31.78 
 
 
463 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  39.02 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  38.21 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  39.84 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  38.79 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  37.4 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>