More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11308 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11308  putative flagellar motor protein MotB  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.890951  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  40.48 
 
 
286 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2921  OmpA/MotB domain-containing protein  41.55 
 
 
277 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751625  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1593  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 
290 aa  205  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.907299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 
285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  36.99 
 
 
294 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2377  OmpA/MotB domain protein  34.38 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447675  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  34.49 
 
 
282 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  31.82 
 
 
321 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  40.15 
 
 
280 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  28.43 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  40.43 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  27.57 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  30.16 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  31.06 
 
 
256 aa  92  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  29.13 
 
 
236 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.45 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  33.83 
 
 
305 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  34.75 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  34.38 
 
 
225 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 
269 aa  85.9  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 
219 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  33.53 
 
 
285 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  34.12 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  25.64 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  31.58 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 
238 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  31.06 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  35.29 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  34.71 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  33.1 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  33.1 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  33.1 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  33.1 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  33.1 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  33.1 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  33.1 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  27.64 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  33.1 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  33.1 
 
 
225 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  34.19 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  26.2 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  29.69 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  29.69 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  29.69 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  34.19 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  34.33 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  32.39 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1270  OmpA/MotB  36.3 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.752029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  29.69 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  34.27 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  30.27 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  29.69 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  34.56 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  35.1 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  28.87 
 
 
799 aa  79  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4077  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 
275 aa  79  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  35.59 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  29.6 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  28.91 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  27.97 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  32.59 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  23.45 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  32.58 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  35.04 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  27.04 
 
 
179 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  37.4 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  31.69 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  32.52 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  33.61 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  33.05 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  35.04 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  31.93 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  40.91 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  34.59 
 
 
241 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  27.92 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  28.8 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  28.8 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  33.55 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  29.77 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  30.3 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27640  Flagellar motor protein  33.07 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  33.87 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  29.2 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  32.37 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>