More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1938 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  100 
 
 
278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  100 
 
 
458 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  99.62 
 
 
458 aa  530  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  46.54 
 
 
433 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  47.31 
 
 
433 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  47.31 
 
 
433 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  44.4 
 
 
434 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  44.02 
 
 
434 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  44.02 
 
 
434 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  44.02 
 
 
434 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  47.13 
 
 
433 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  45.04 
 
 
436 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  41.96 
 
 
432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  45.8 
 
 
434 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  41.92 
 
 
434 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  41.31 
 
 
431 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  39.77 
 
 
447 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  38.61 
 
 
429 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  37.4 
 
 
415 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  38.4 
 
 
443 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  38.22 
 
 
421 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  38.22 
 
 
426 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  38.22 
 
 
421 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  38.22 
 
 
421 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  37.45 
 
 
421 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  37.45 
 
 
421 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  37.45 
 
 
421 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  38.7 
 
 
414 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  36.58 
 
 
406 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  36.26 
 
 
460 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  34.47 
 
 
452 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  33.33 
 
 
443 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  33.84 
 
 
453 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  35.02 
 
 
413 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  33.72 
 
 
438 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  33.33 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  33.33 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  33.33 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  33.33 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  33.33 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  33.33 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  33.6 
 
 
449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  32.95 
 
 
460 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  31.48 
 
 
440 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  31.85 
 
 
437 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  32.81 
 
 
449 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  33.97 
 
 
430 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  28.52 
 
 
469 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.21 
 
 
442 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  28.26 
 
 
456 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  28.68 
 
 
410 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.75 
 
 
494 aa  102  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  27.91 
 
 
552 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  27.91 
 
 
571 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  27.91 
 
 
552 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  27.84 
 
 
405 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  30.83 
 
 
438 aa  98.2  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  27.8 
 
 
594 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  27.52 
 
 
560 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  27.52 
 
 
571 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  27.52 
 
 
552 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  27.52 
 
 
552 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.32 
 
 
404 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  27.17 
 
 
430 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.41 
 
 
429 aa  93.6  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 
219 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 
463 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  27.01 
 
 
404 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  35.38 
 
 
272 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  34.75 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  38.89 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  28.95 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
228 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  28.4 
 
 
493 aa  82.4  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  37.74 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  34.51 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  34.51 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  33.09 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  37.17 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  36 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  29.04 
 
 
453 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  37.3 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.04 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  26.35 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  35.88 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  35 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  31.25 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  36.23 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  31.21 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 
218 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>