More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0716 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  98.39 
 
 
560 aa  1053    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  99.82 
 
 
552 aa  1109    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  99.82 
 
 
571 aa  1111    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1112    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1113    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  94.03 
 
 
594 aa  988    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  99.82 
 
 
552 aa  1109    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1112    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  39.79 
 
 
536 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  39.79 
 
 
536 aa  290  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  40.21 
 
 
535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  30.54 
 
 
460 aa  137  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  30.69 
 
 
443 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  31.95 
 
 
460 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  28.46 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  28.5 
 
 
452 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  29.38 
 
 
432 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  28.35 
 
 
431 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  30.47 
 
 
430 aa  124  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.82 
 
 
442 aa  123  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  27.47 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  29.03 
 
 
434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  27.2 
 
 
458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  28.82 
 
 
413 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  28.47 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  28.47 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  29.78 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  29.78 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  28.47 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  28.47 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  28.47 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  28.47 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  28.47 
 
 
438 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  28.18 
 
 
434 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  28.18 
 
 
434 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  28.82 
 
 
437 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  27.9 
 
 
434 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  27.9 
 
 
434 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  32.26 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  27.16 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  28.89 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  29.53 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  27.09 
 
 
421 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  27.09 
 
 
421 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  27.09 
 
 
426 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  27.09 
 
 
421 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  27.09 
 
 
421 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  27.09 
 
 
421 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  27.09 
 
 
421 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  29.5 
 
 
434 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  25.06 
 
 
469 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  27.21 
 
 
443 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  28.57 
 
 
433 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  27.25 
 
 
453 aa  107  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  26.26 
 
 
430 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  28.73 
 
 
456 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  29.8 
 
 
436 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  24.15 
 
 
447 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  25.55 
 
 
429 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  27.91 
 
 
278 aa  100  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  27.27 
 
 
487 aa  98.6  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  26.58 
 
 
414 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  24.04 
 
 
429 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  29.35 
 
 
404 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.24 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  27.76 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.5 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  31.34 
 
 
293 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  26.89 
 
 
405 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  31.55 
 
 
310 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  28.12 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  28.32 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  30.48 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  29.25 
 
 
511 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  31.38 
 
 
291 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  35.07 
 
 
291 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  33.18 
 
 
449 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  26.41 
 
 
463 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  29.63 
 
 
289 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.67 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  32.14 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  29.65 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  30.32 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  28.86 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  29.1 
 
 
289 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  33.56 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.38 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  32.68 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  29.81 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  34.53 
 
 
255 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  34.53 
 
 
255 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  32.8 
 
 
280 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  32.4 
 
 
257 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.88 
 
 
258 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  32.1 
 
 
252 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.38 
 
 
258 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  32.1 
 
 
252 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 
374 aa  64.7  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  31.34 
 
 
227 aa  64.3  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  27.69 
 
 
329 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>