More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3551 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  99.63 
 
 		 536 aa  1111    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1115    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  99.63 
 
 		 535 aa  1055    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  39.79 
 
 		 571 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  40.05 
 
 		 594 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  39.79 
 
 		 552 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  39.79 
 
 		 552 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  39.53 
 
 		 571 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  39.53 
 
 		 552 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  39.53 
 
 		 552 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  39.53 
 
 		 560 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  29.21 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  30.21 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  30.21 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  30.21 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  28.75 
 
 		 452 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  27.82 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  28.97 
 
 		 440 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  29.14 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  28.42 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  29.1 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  28.31 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  27.34 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  28.01 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  28.01 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  27.76 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  27.76 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  27.76 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  27.76 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  27.76 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  27.76 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  27.76 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  28.65 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  28.23 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  30.08 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  25.71 
 
 		 434 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  29.53 
 
 		 434 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  30.08 
 
 		 434 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  29.82 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  29.13 
 
 		 438 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  28.01 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  26.06 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  26.12 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  27.22 
 
 		 414 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  25.19 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  24.48 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  26.29 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  25.59 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  25.86 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  25.86 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  25.86 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  25.59 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  25.59 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  25.86 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  26.76 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  25.07 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  25.07 
 
 		 430 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.24 
 
 		 258 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.78 
 
 		 258 aa  97.8  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.6 
 
 		 258 aa  97.4  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.4 
 
 		 429 aa  90.5  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  23.37 
 
 		 487 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  24.94 
 
 		 410 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  23.49 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  24.29 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  26.12 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  40.69 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  34.48 
 
 		 273 aa  83.2  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  36.84 
 
 		 252 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  36.84 
 
 		 252 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  37.31 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  37.31 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  36.57 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  27.99 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  25.13 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  22.32 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  29.49 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  29.73 
 
 		 289 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.21 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2000  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 167 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  38.28 
 
 		 254 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  30.64 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  24.86 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  23.92 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  30.32 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 367 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  34.29 
 
 		 366 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  30.87 
 
 		 305 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 366 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  31.01 
 
 		 310 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  72  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  37.88 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  26.11 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  26.69 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1672  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>