More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5862 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5862  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4998  OmpA/MotB  99.03 
 
 		 119 aa  203  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  58.25 
 
 		 405 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  56.86 
 
 		 404 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  55.45 
 
 		 404 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  52.38 
 
 		 447 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  50 
 
 		 410 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  52.58 
 
 		 431 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  51.81 
 
 		 434 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  51.19 
 
 		 443 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  45.28 
 
 		 432 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  45.74 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  45.37 
 
 		 463 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  47.37 
 
 		 421 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  47.37 
 
 		 421 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  47.37 
 
 		 421 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  47.37 
 
 		 426 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  47.37 
 
 		 421 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  47.37 
 
 		 421 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  47.37 
 
 		 421 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  43.88 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  41 
 
 		 434 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  51.32 
 
 		 244 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  48.1 
 
 		 433 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  42 
 
 		 433 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  42 
 
 		 433 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  42 
 
 		 433 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  45.68 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  45.68 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  45.68 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  44.87 
 
 		 434 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.84 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  44.87 
 
 		 434 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  43.59 
 
 		 434 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  44.87 
 
 		 434 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  41.24 
 
 		 217 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  46.25 
 
 		 436 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 		 215 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  39.08 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 459 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  43.37 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.02 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 456 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 264 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  44.74 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2736  OmpA/MotB domain protein  43.42 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  36.36 
 
 		 241 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 241 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 239 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  45.45 
 
 		 536 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  45.45 
 
 		 535 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  43.21 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 266 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  45.45 
 
 		 536 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  46.05 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  46.05 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  42.47 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  43.33 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  41.98 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  44.16 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  48.15 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  48 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  46.15 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  41.38 
 
 		 464 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  43.04 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  44 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  37.11 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  37.11 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  43.04 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  37.11 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  38.14 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  37.11 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  37.11 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  39.13 
 
 		 230 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  36.73 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  40.22 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  44.44 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  37.11 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  37.11 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  38.04 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  45.33 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  46.75 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  44 
 
 		 449 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  38.04 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  41.98 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  40 
 
 		 511 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.04 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  41.25 
 
 		 367 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 453 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  38.54 
 
 		 257 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  44 
 
 		 267 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  42.22 
 
 		 443 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>