More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4998 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4998  OmpA/MotB  100 
 
 
119 aa  236  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5862  OmpA/MotB domain-containing protein  99.03 
 
 
103 aa  203  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  57.41 
 
 
405 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  54.63 
 
 
404 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  54.63 
 
 
404 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  49.59 
 
 
447 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  48.11 
 
 
410 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  49.09 
 
 
431 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  45.45 
 
 
434 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  45.45 
 
 
432 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  43.24 
 
 
443 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  44.55 
 
 
421 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  44.55 
 
 
426 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  44.55 
 
 
421 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  44.55 
 
 
421 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  44.55 
 
 
421 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  42.34 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  44.55 
 
 
421 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  44.55 
 
 
421 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 
463 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  42.73 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  40.91 
 
 
434 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  41.82 
 
 
433 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  40.91 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  40.91 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  40.91 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  41.44 
 
 
436 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  37.27 
 
 
278 aa  72  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  37.27 
 
 
458 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  37.27 
 
 
458 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  51.32 
 
 
244 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  39.45 
 
 
434 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  39.45 
 
 
434 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  39.45 
 
 
434 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  38.53 
 
 
434 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 
456 aa  71.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.84 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  34.96 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  36.84 
 
 
337 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 
275 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 
208 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
217 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 
305 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
215 aa  66.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  37.84 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  36.04 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  39.2 
 
 
453 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 
459 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.02 
 
 
330 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  44.74 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  35.09 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  34.91 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  33.96 
 
 
328 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  37.39 
 
 
536 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  37.39 
 
 
535 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  37.39 
 
 
536 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  37.38 
 
 
273 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  36.54 
 
 
261 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  35.58 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  37.38 
 
 
273 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2736  OmpA/MotB domain protein  43.42 
 
 
242 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  43.42 
 
 
239 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  37.74 
 
 
511 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 
224 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 
257 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 
224 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  30.84 
 
 
259 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  35.58 
 
 
316 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  43.21 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  43.33 
 
 
234 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 
206 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 
275 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 
239 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  48.15 
 
 
261 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 
207 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  41.98 
 
 
326 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  36.7 
 
 
449 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.86 
 
 
248 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 
256 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  42.47 
 
 
355 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  48 
 
 
168 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  43.04 
 
 
242 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2000  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297177  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
366 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  42.86 
 
 
464 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  36.7 
 
 
449 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>