More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1946 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1946  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
257 aa  531  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0980886  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  31.19 
 
 
329 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
309 aa  129  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  32.62 
 
 
245 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  33.19 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  31.66 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  31.76 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  27.21 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  29.49 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  27.94 
 
 
288 aa  112  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  28.24 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  28.74 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  27.39 
 
 
288 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  31.76 
 
 
266 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  27.23 
 
 
253 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  29.58 
 
 
259 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  28.97 
 
 
275 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  27.66 
 
 
254 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  25.82 
 
 
246 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  26.86 
 
 
263 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  25.79 
 
 
271 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  31.3 
 
 
241 aa  102  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  29.18 
 
 
256 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2765  flagellar motor protein MotB  28.02 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  26.69 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  56.76 
 
 
330 aa  99  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  27.92 
 
 
305 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  26.25 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  27.46 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  26.02 
 
 
286 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  28.07 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  58.9 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  58.11 
 
 
305 aa  96.3  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  26.27 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.05 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  25.71 
 
 
266 aa  95.5  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  59.46 
 
 
314 aa  95.5  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  57.53 
 
 
310 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  26.16 
 
 
275 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  25.19 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  57.53 
 
 
310 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  57.53 
 
 
310 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  57.53 
 
 
310 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  58.11 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  57.53 
 
 
322 aa  95.5  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  25.85 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  27 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  56.16 
 
 
322 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  54.32 
 
 
314 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  25.19 
 
 
305 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  58.11 
 
 
318 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  56.16 
 
 
308 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  28.02 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  29.39 
 
 
253 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  26.61 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  56.16 
 
 
325 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  57.53 
 
 
306 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  57.53 
 
 
306 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  57.53 
 
 
306 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  27.59 
 
 
296 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  25.85 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  56.16 
 
 
312 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  56.16 
 
 
308 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  54.05 
 
 
309 aa  92.8  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  58.9 
 
 
315 aa  92.8  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  58.9 
 
 
314 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1716  chemotaxis protein PomB  33.61 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.81071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1807  OmpA/MotB  28.76 
 
 
229 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.423379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  25.32 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  24.33 
 
 
280 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  26.12 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  26.14 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  25.73 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  25.81 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  35.23 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  26.74 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  25.93 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  26.16 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  24.07 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  26.42 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  26.02 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  23.21 
 
 
244 aa  86.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  24.5 
 
 
265 aa  85.9  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  24.46 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  32.34 
 
 
225 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  26.27 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  25 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  30.8 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  35.42 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2320  OmpA/MotB domain-containing protein  35.5 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000584823  hitchhiker  0.000182851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1525  putative chemotaxis MotB protein  24 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  27.15 
 
 
273 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  28.18 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  25.4 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  24.79 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  28.99 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1270  OmpA/MotB  34.03 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.752029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  27.78 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1018  OmpA/MotB domain protein  25.79 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  44.33 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>