More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0800 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  89.74 
 
 		 341 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  86.51 
 
 		 341 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  85.67 
 
 		 342 aa  584  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  85.67 
 
 		 343 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  86.8 
 
 		 341 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  81.58 
 
 		 342 aa  567  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  61.81 
 
 		 343 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  61.52 
 
 		 343 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  62.17 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  61.74 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  59.77 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  59.77 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  62.69 
 
 		 337 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  58.89 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  59.18 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  59.01 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  61.19 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  55.69 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  61 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  57.31 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  60.6 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  60.23 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  60.23 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  54.97 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  48.38 
 
 		 375 aa  326  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  52.51 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  44.8 
 
 		 374 aa  291  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  44.81 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  48.18 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  42.27 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  44.02 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  47.08 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  47.64 
 
 		 525 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  47.44 
 
 		 648 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  46.35 
 
 		 525 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  46.35 
 
 		 525 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  46.53 
 
 		 784 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  44.81 
 
 		 463 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  46.67 
 
 		 799 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  32.26 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.07 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  29.26 
 
 		 287 aa  99.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  41.94 
 
 		 179 aa  96.3  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  33.18 
 
 		 245 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 266 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  30.17 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.09 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 257 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  43.22 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 271 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 288 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  45.22 
 
 		 259 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  42.61 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  44.25 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  30.36 
 
 		 266 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 242 aa  86.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  42.61 
 
 		 256 aa  86.3  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  30.11 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  41.23 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  29.57 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  29.9 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  36.92 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  45.22 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0967  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  28.87 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  28.87 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  28.87 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  39.17 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  40.87 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  40 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  28.87 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  28.87 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  28.87 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  28.87 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  40.8 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.88 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  28.35 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  41.38 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  28.49 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  37.41 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  32.46 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  45.28 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  30.86 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  39.32 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>