More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2098 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
338 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  60.12 
 
 
343 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  58.38 
 
 
343 aa  381  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  55.07 
 
 
343 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  56.76 
 
 
343 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  55.65 
 
 
341 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  56.23 
 
 
342 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  55.81 
 
 
343 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  55.65 
 
 
342 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  55.81 
 
 
341 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  53.62 
 
 
343 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  56.98 
 
 
341 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  53.73 
 
 
340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  53.91 
 
 
343 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  55.62 
 
 
341 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  56.62 
 
 
337 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  55.62 
 
 
337 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  56.21 
 
 
337 aa  348  7e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  51.73 
 
 
342 aa  348  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  53.33 
 
 
345 aa  345  7e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  55.99 
 
 
337 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  53.18 
 
 
314 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  55.35 
 
 
337 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  55.35 
 
 
337 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  52.91 
 
 
337 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  47.62 
 
 
375 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  50.15 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 
374 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  47.34 
 
 
342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  46.28 
 
 
362 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 
348 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  50.35 
 
 
427 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  41.62 
 
 
326 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  44.02 
 
 
525 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  44.21 
 
 
525 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  43.35 
 
 
525 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  45.87 
 
 
799 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  38.61 
 
 
463 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  39.43 
 
 
784 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  41.7 
 
 
648 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  32.37 
 
 
289 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  42.02 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 
245 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  31.17 
 
 
291 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 
271 aa  96.7  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 
256 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  29.86 
 
 
287 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  33.07 
 
 
266 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  43.65 
 
 
242 aa  92.8  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  31.18 
 
 
292 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  41.59 
 
 
249 aa  90.1  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  33.94 
 
 
338 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  38.26 
 
 
256 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  38.13 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  40.8 
 
 
275 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.36 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  34.94 
 
 
286 aa  86.7  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  31.12 
 
 
266 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 
271 aa  85.9  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  29.54 
 
 
299 aa  85.9  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  42.28 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  43.59 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  34.71 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  42.15 
 
 
223 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  42.15 
 
 
223 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  42.5 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  39.84 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  42.15 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  41.74 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  36.52 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  36.84 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  39.82 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  39.13 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  36.75 
 
 
244 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  42.15 
 
 
228 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1171  MotB-like flagellar protein  34.81 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  30.68 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  37.3 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  37.11 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  37.6 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  37.91 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  41.74 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  41.03 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 
258 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  38.1 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  40.5 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  38.79 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  30.49 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>