More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1710 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
342 aa  680    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  46.87 
 
 
343 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  47.49 
 
 
343 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  44.77 
 
 
343 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  46.36 
 
 
342 aa  292  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  47.49 
 
 
343 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  42.73 
 
 
343 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  42.23 
 
 
343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  44.21 
 
 
341 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  44.74 
 
 
341 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  44.35 
 
 
343 aa  275  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  48.22 
 
 
338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  44.44 
 
 
342 aa  272  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  40.59 
 
 
375 aa  272  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  43.93 
 
 
342 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  45.13 
 
 
326 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  43.45 
 
 
341 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  43.86 
 
 
341 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 
340 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  42.07 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  40.7 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  40.94 
 
 
337 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  42.18 
 
 
337 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  44.05 
 
 
337 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  37.95 
 
 
362 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
337 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  41.76 
 
 
337 aa  222  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  42.47 
 
 
337 aa  222  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 
337 aa  222  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  35.73 
 
 
374 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  31.72 
 
 
427 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  43.78 
 
 
648 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  42.22 
 
 
525 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  43.78 
 
 
784 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  41.78 
 
 
525 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  41.78 
 
 
525 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  38.04 
 
 
463 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  38.21 
 
 
799 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0148  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 
258 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  29.65 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  33.85 
 
 
290 aa  77  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1016  OmpA/MotB  44.32 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0690  OmpA family protein  37.12 
 
 
219 aa  72  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.398507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  31.02 
 
 
212 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  33.53 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  29.36 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  31.44 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  38.14 
 
 
429 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  33.11 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  28.14 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  32.53 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  33.58 
 
 
179 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  28.99 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3560  hypothetical protein  32.53 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227578  normal  0.135596 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  31.1 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5401  hypothetical protein  32.53 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  35.9 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  35.11 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  39.02 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  34.17 
 
 
217 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5051  hypothetical protein  31.93 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.325603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  32.76 
 
 
248 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  33.86 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  32.28 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3587  chemotaxis protein MotB  31.15 
 
 
242 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  37.07 
 
 
432 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  33.33 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0505  hypothetical protein  33.06 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  37.93 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  33.08 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  31.45 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3866  hypothetical protein  32.32 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4708  hypothetical protein  32.32 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  37.97 
 
 
246 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  33.88 
 
 
231 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3655  hypothetical protein  32.32 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0802029  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  35.51 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 
228 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  28.41 
 
 
287 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  35.9 
 
 
431 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0116  hypothetical protein  31.39 
 
 
215 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56852  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1115  hypothetical protein  31.39 
 
 
215 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0267  hypothetical protein  31.39 
 
 
215 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0310  hypothetical protein  31.39 
 
 
215 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  26.8 
 
 
248 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1285  hypothetical protein  31.39 
 
 
215 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5082  hypothetical protein  31.21 
 
 
217 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.343747  normal  0.389351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1788  hypothetical protein  31.39 
 
 
215 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1702  hypothetical protein  31.39 
 
 
215 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03061  hypothetical protein  32.12 
 
 
215 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  32.33 
 
 
288 aa  63.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  23.33 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>