More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3239 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  70.18 
 
 		 215 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  69.27 
 
 		 215 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  70.18 
 
 		 215 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3905  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  308  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0618479  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  71.1 
 
 		 215 aa  305  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5082  hypothetical protein  71.03 
 
 		 217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.343747  normal  0.389351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  69.01 
 
 		 214 aa  300  9e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03061  hypothetical protein  70.09 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0116  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56852  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1115  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1702  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0267  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0310  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1788  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1285  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426387  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4708  hypothetical protein  68.35 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3866  hypothetical protein  68.35 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3655  hypothetical protein  68.35 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0802029  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5401  hypothetical protein  69.34 
 
 		 214 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  69.05 
 
 		 214 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3560  hypothetical protein  68.4 
 
 		 214 aa  287  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227578  normal  0.135596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5051  hypothetical protein  68.57 
 
 		 214 aa  287  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  71.15 
 
 		 224 aa  286  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  66.05 
 
 		 212 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0505  hypothetical protein  69.52 
 
 		 220 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  56.8 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  31.07 
 
 		 289 aa  86.3  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.76 
 
 		 256 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  29.31 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  38.18 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  36.77 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  39.53 
 
 		 342 aa  81.3  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 288 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  36.09 
 
 		 799 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  34.67 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  36.43 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  37.98 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  36.43 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  37.98 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  37.21 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  38.58 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  34.09 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  34.85 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  33.53 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  33.16 
 
 		 272 aa  71.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  35.22 
 
 		 279 aa  71.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  35.64 
 
 		 648 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  31.1 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  35.25 
 
 		 784 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  33.08 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  42.53 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  25.93 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  37.3 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  34.66 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  34.11 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 		 498 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  35.94 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  31.28 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  36.59 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  36.92 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  31.67 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  35.57 
 
 		 525 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  35.57 
 
 		 525 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  37.61 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  34.11 
 
 		 345 aa  68.6  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  36.28 
 
 		 312 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  33.57 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  36.75 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  32.7 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  33.57 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  33.87 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  36.43 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  34.29 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  31.47 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  34.25 
 
 		 463 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 623 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  35.66 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  36.51 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  36.75 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  34.81 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1969  flagellar motor protein MotD  36.36 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  34.75 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>