More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04090 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  78.67 
 
 
212 aa  329  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  77.03 
 
 
215 aa  322  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  77.03 
 
 
215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_003296  RS03061  hypothetical protein  76.44 
 
 
215 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1115  hypothetical protein  76.92 
 
 
215 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0267  hypothetical protein  76.92 
 
 
215 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0116  hypothetical protein  76.92 
 
 
215 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56852  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1702  hypothetical protein  76.92 
 
 
215 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0310  hypothetical protein  76.92 
 
 
215 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1788  hypothetical protein  76.92 
 
 
215 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1285  hypothetical protein  76.92 
 
 
215 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  76.08 
 
 
215 aa  315  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  76.92 
 
 
215 aa  315  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5051  hypothetical protein  72.09 
 
 
214 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.325603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3866  hypothetical protein  71.16 
 
 
214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4708  hypothetical protein  71.16 
 
 
214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3655  hypothetical protein  71.16 
 
 
214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0802029  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  70.7 
 
 
214 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3560  hypothetical protein  71.16 
 
 
214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227578  normal  0.135596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5401  hypothetical protein  71.16 
 
 
214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5082  hypothetical protein  71.16 
 
 
217 aa  298  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.343747  normal  0.389351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3905  hypothetical protein  70.14 
 
 
215 aa  297  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0618479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  71.15 
 
 
218 aa  286  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  67.8 
 
 
214 aa  285  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0505  hypothetical protein  61.57 
 
 
220 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  57.97 
 
 
217 aa  218  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  36.84 
 
 
343 aa  89  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  40.15 
 
 
314 aa  88.6  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  35.67 
 
 
343 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  35.12 
 
 
343 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  36.97 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  36.97 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  36.53 
 
 
375 aa  82  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  38.06 
 
 
343 aa  78.2  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  35.5 
 
 
341 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  29.17 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  38.65 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  35.67 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  31.45 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  32.65 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  33.11 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  34.57 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  41.46 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  34.07 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  30.67 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  35.19 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  35.63 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  33.73 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  38.02 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  34.32 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  28.69 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  34.32 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  30.06 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  34.32 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  27.91 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  38.51 
 
 
434 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  38.79 
 
 
288 aa  72  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  28.65 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  34.87 
 
 
799 aa  71.6  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  38.89 
 
 
296 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  33.13 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  34.32 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  36.18 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  34.87 
 
 
525 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  34.87 
 
 
525 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  36.84 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  31 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  31.95 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  31 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  34.87 
 
 
525 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  36.22 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  30.96 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  32.9 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4077  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  29.14 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  34.65 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  25.53 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
487 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  37.6 
 
 
784 aa  68.6  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  38.03 
 
 
463 aa  68.6  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  32.2 
 
 
305 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  36.44 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>