More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3905 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3905  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0618479  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5082  hypothetical protein  78.7 
 
 		 217 aa  344  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.343747  normal  0.389351 
 
 
-
 
NC_003296  RS03061  hypothetical protein  78.14 
 
 		 215 aa  343  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  78.04 
 
 		 215 aa  342  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  76.17 
 
 		 215 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  77.78 
 
 		 215 aa  330  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  73.58 
 
 		 215 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1115  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0267  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0116  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1285  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426387  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0310  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1788  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1702  hypothetical protein  71.63 
 
 		 215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5401  hypothetical protein  74.4 
 
 		 214 aa  317  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3655  hypothetical protein  72.95 
 
 		 214 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0802029  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4708  hypothetical protein  72.95 
 
 		 214 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3866  hypothetical protein  72.95 
 
 		 214 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3560  hypothetical protein  73.43 
 
 		 214 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227578  normal  0.135596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  72.46 
 
 		 214 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5051  hypothetical protein  69.95 
 
 		 214 aa  309  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  71.63 
 
 		 218 aa  308  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  68.87 
 
 		 212 aa  300  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  70.14 
 
 		 224 aa  297  8e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  68.78 
 
 		 214 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0505  hypothetical protein  67 
 
 		 220 aa  254  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  54.19 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  33.74 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  37.76 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  33.92 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  32.1 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  36.94 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  32.1 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  28.84 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  36.31 
 
 		 375 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  35.26 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  34.09 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  35.43 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  31.36 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  29.15 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  33.97 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  39.66 
 
 		 288 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  35.2 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  34.09 
 
 		 343 aa  71.6  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  30.66 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  35.29 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  36.62 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  35.25 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  36.09 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  35.29 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  35.29 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  34.85 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  34.85 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  33.78 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  36.84 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  33.06 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  34.81 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3735  OmpA/MotB domain-containing protein  28.14 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0166523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4629  OmpA/MotB  28.14 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  35.9 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  33.6 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  31.95 
 
 		 342 aa  68.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 272 aa  68.2  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  31.21 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  34.75 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  35.46 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  34.21 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  31.95 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  30.57 
 
 		 447 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  35.45 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  35.07 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  27.5 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  34.21 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  29.81 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  34.19 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  28.38 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  25.66 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  40 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  34.59 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  39.06 
 
 		 648 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>