More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03061 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03061  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  84.11 
 
 		 215 aa  360  9e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  83.18 
 
 		 215 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  84.62 
 
 		 215 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1115  hypothetical protein  81.86 
 
 		 215 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0267  hypothetical protein  81.86 
 
 		 215 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1702  hypothetical protein  81.86 
 
 		 215 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1788  hypothetical protein  81.86 
 
 		 215 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0116  hypothetical protein  81.86 
 
 		 215 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1285  hypothetical protein  81.86 
 
 		 215 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426387  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0310  hypothetical protein  81.86 
 
 		 215 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  83.81 
 
 		 215 aa  352  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3905  hypothetical protein  78.14 
 
 		 215 aa  343  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0618479  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5051  hypothetical protein  81.52 
 
 		 214 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4708  hypothetical protein  79.62 
 
 		 214 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3866  hypothetical protein  79.62 
 
 		 214 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3655  hypothetical protein  79.62 
 
 		 214 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0802029  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  79.62 
 
 		 214 aa  339  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3560  hypothetical protein  80.09 
 
 		 214 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227578  normal  0.135596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5401  hypothetical protein  79.62 
 
 		 214 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5082  hypothetical protein  77.25 
 
 		 217 aa  325  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.343747  normal  0.389351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  79.8 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  76.44 
 
 		 224 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  70.09 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  67.14 
 
 		 214 aa  294  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0505  hypothetical protein  66.99 
 
 		 220 aa  254  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  58.1 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  36.59 
 
 		 289 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  28.91 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  36.84 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  36.16 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  34.64 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  32.72 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  33.73 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  34.09 
 
 		 343 aa  78.2  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  36.22 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  35.12 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  31.29 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  34.62 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  34.36 
 
 		 799 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  35.83 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  34.09 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  36.84 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  36.84 
 
 		 343 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  35.29 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  35.29 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  35.29 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  32.05 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  34.81 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  26.69 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  31.06 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  32.18 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  37.07 
 
 		 296 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  36.59 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  37.01 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  39.84 
 
 		 648 aa  68.6  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  34.48 
 
 		 525 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  34.75 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  33.85 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  41.98 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0770  OmpA/MotB domain protein  29.82 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  35.94 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  29.65 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  29.59 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  25.37 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.23 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  28.06 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  35.34 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  33.71 
 
 		 337 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  35.38 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  29.59 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4077  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  36.5 
 
 		 784 aa  65.1  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  26.4 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 337 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  32.46 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3431  flagellar motor protein MotD  32.46 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 		 337 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  36.59 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  36.19 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  37.01 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  29.58 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>