More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0802 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 578 aa  1150    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  99.65 
 
 		 578 aa  1147    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  77.5 
 
 		 573 aa  841    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  98.79 
 
 		 578 aa  1139    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  48.19 
 
 		 569 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  43.76 
 
 		 550 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  39.04 
 
 		 576 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  33.92 
 
 		 572 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  33.66 
 
 		 575 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  31.97 
 
 		 587 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  57.72 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 552 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  32.59 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  28.1 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  28.1 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  32.11 
 
 		 542 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  28.03 
 
 		 558 aa  123  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  38.33 
 
 		 560 aa  90.9  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 		 560 aa  90.9  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  37.5 
 
 		 560 aa  87.4  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.57 
 
 		 607 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  42.57 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.32 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.07 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.32 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.05 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.25 
 
 		 542 aa  77  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.69 
 
 		 609 aa  76.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 231 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.5 
 
 		 224 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 		 544 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2913  hypothetical protein  32.48 
 
 		 181 aa  75.5  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  38.79 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  33.04 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  38.1 
 
 		 640 aa  74.7  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  35.94 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  49.33 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  37.17 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.07 
 
 		 242 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  32.86 
 
 		 468 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 225 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  33.57 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  40 
 
 		 641 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 261 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  50.67 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 210 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.72 
 
 		 230 aa  72.4  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  50.67 
 
 		 243 aa  72.8  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  36.11 
 
 		 222 aa  72  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  46.25 
 
 		 223 aa  72  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 		 230 aa  72  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.25 
 
 		 673 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 217 aa  72  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  54.17 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  44.87 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  34.82 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.5 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  36.07 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  32.86 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  36.21 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  42.39 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.22 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  36.7 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 229 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 263 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 217 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  33.62 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 220 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  47.3 
 
 		 451 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  42.59 
 
 		 219 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  43.68 
 
 		 229 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 630 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  34.23 
 
 		 631 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  35.4 
 
 		 694 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 222 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>