More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6672 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 552 aa  1097    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  71.87 
 
 		 555 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  45.17 
 
 		 558 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  47.21 
 
 		 542 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  44.99 
 
 		 558 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  45.26 
 
 		 558 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  34.71 
 
 		 572 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  35.41 
 
 		 575 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  32.75 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  25.67 
 
 		 560 aa  146  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  25.45 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  25.45 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  33.56 
 
 		 569 aa  137  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0781  OmpA domain-containing protein  36.71 
 
 		 573 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0802  OmpA/MotB domain-containing protein  29.48 
 
 		 578 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2507  OmpA domain-containing protein  29.31 
 
 		 578 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  33.56 
 
 		 576 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0730  OmpA domain-containing protein  29.31 
 
 		 578 aa  133  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  31.9 
 
 		 550 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  40.5 
 
 		 383 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  34.27 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  32.7 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.42 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  34.44 
 
 		 262 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.06 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  32.46 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  33.65 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 264 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 		 236 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40.74 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  37.29 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  37.82 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  33.15 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  36.07 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  35.4 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.11 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.39 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 		 175 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.89 
 
 		 261 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.5 
 
 		 427 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 270 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  37.86 
 
 		 1313 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.89 
 
 		 261 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 229 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 169 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  37.96 
 
 		 252 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  39 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  33.79 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  30.19 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  39.78 
 
 		 631 aa  75.1  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 1026 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  45.12 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  39.08 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.9 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.24 
 
 		 609 aa  73.9  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  42.06 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  35.4 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  38.83 
 
 		 268 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 227 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  39.77 
 
 		 630 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  35.64 
 
 		 364 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  31.03 
 
 		 641 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.23 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 228 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  35.59 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  34.48 
 
 		 215 aa  72.8  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 270 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  40 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  34.21 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 270 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 543 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 228 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  40.74 
 
 		 269 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.86 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  42 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.26 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  33.33 
 
 		 694 aa  71.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.61 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  37 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>