More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0218 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 642 aa  1255    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  87.06 
 
 		 652 aa  1056    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  87.06 
 
 		 652 aa  1061    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  47.22 
 
 		 653 aa  535  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  48.42 
 
 		 658 aa  515  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  49.49 
 
 		 768 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  47.38 
 
 		 617 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  28.94 
 
 		 729 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  29.34 
 
 		 459 aa  123  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  30.97 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  31.73 
 
 		 464 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  26.62 
 
 		 464 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  27.84 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  30.05 
 
 		 463 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  30.88 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  30.17 
 
 		 463 aa  107  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  27.57 
 
 		 707 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  31.44 
 
 		 277 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  40.65 
 
 		 451 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  30.67 
 
 		 316 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  30.67 
 
 		 316 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  42.52 
 
 		 441 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  39.83 
 
 		 434 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 316 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.25 
 
 		 320 aa  94.7  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  30.25 
 
 		 316 aa  94  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 316 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  30.25 
 
 		 247 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  29.83 
 
 		 320 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  30.67 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  30.67 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  30.67 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  30.67 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  30.67 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  30.67 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  30.67 
 
 		 310 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  40.35 
 
 		 222 aa  91.3  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  41.23 
 
 		 233 aa  90.1  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 229 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  38.74 
 
 		 222 aa  90.1  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  29.75 
 
 		 311 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  43.69 
 
 		 217 aa  88.6  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 215 aa  88.6  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  41.23 
 
 		 229 aa  89  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  44.23 
 
 		 218 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  43.69 
 
 		 217 aa  87.8  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 229 aa  87.8  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 169 aa  87.4  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  27.16 
 
 		 261 aa  87.4  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  39.64 
 
 		 260 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  39.64 
 
 		 260 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40 
 
 		 319 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 229 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  38.28 
 
 		 449 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 221 aa  86.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.41 
 
 		 352 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.1 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  43.27 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  39.06 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.06 
 
 		 542 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.31 
 
 		 543 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 209 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 236 aa  83.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  40.98 
 
 		 537 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 230 aa  82.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 224 aa  82.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.16 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  33.91 
 
 		 694 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.31 
 
 		 544 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.75 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  42.31 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 215 aa  80.1  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  42.48 
 
 		 236 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 247 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  42.31 
 
 		 212 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 240 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  42.72 
 
 		 214 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  37.4 
 
 		 288 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.33 
 
 		 673 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 638 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.12 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 215 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.72 
 
 		 217 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  41.35 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 215 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  40.38 
 
 		 241 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  32.19 
 
 		 229 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  32.43 
 
 		 903 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  37.74 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 217 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>