More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3164 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 486 aa  978    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  30.34 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  30.65 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  28.03 
 
 		 420 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  29.69 
 
 		 429 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  28.67 
 
 		 450 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  35.81 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  27.86 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  33.76 
 
 		 487 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  29.12 
 
 		 374 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  45.1 
 
 		 466 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  45.54 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  38.56 
 
 		 381 aa  98.2  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  28.67 
 
 		 320 aa  96.7  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  32.8 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  32.12 
 
 		 454 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 459 aa  94  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  44.12 
 
 		 345 aa  90.5  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  37.31 
 
 		 466 aa  90.5  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  37.06 
 
 		 468 aa  90.5  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  33.54 
 
 		 380 aa  90.1  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  43.3 
 
 		 673 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  28.82 
 
 		 727 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  41.6 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  41.6 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 		 388 aa  87.8  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  42.86 
 
 		 261 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  42.86 
 
 		 261 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  41.6 
 
 		 344 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  27.76 
 
 		 456 aa  87.4  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 333 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.77 
 
 		 223 aa  87  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 360 aa  86.7  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  41.6 
 
 		 345 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 		 359 aa  86.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  43.81 
 
 		 261 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43 
 
 		 337 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  43.88 
 
 		 217 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.6 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.8 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  47.96 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  34.21 
 
 		 631 aa  83.6  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 		 326 aa  83.2  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  43.81 
 
 		 264 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  41.84 
 
 		 337 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  44.9 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.75 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  40 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  37.06 
 
 		 186 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  29.23 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  43.81 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  38.52 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  42.59 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  39.42 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  37.5 
 
 		 328 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1987 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 261 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  42.86 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.6 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  40.82 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  32.39 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.71 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  41.12 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 263 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 270 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 270 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 263 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  41.12 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  39.32 
 
 		 270 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  38.61 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 216 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  44.9 
 
 		 248 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  40.74 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  42.86 
 
 		 221 aa  75.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 216 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  58.33 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  36.88 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  38.61 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  39.45 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  45.98 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  39.45 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  39.45 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  39.45 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  24.49 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  38.41 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>