More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3061 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  85.13 
 
 		 435 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  85.13 
 
 		 435 aa  688    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 435 aa  866    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  86.36 
 
 		 435 aa  704    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  53.81 
 
 		 451 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  55.2 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  55.9 
 
 		 447 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  56.47 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  55.53 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  56.37 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  55.92 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  44.2 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  44.6 
 
 		 562 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 558 aa  309  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  41.97 
 
 		 734 aa  292  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  39.43 
 
 		 519 aa  266  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  27.53 
 
 		 585 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  26.91 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  29 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  32.74 
 
 		 270 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  28.9 
 
 		 268 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  33.63 
 
 		 281 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  32 
 
 		 271 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  30.16 
 
 		 284 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  30.26 
 
 		 272 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  31.33 
 
 		 281 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  32.9 
 
 		 281 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  29.47 
 
 		 273 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  33.91 
 
 		 274 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  30.7 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  31.39 
 
 		 272 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  31.39 
 
 		 272 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  28.19 
 
 		 290 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  31.39 
 
 		 272 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  30.99 
 
 		 301 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  32.23 
 
 		 287 aa  106  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  29.82 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  33.33 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  34.53 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  29.82 
 
 		 276 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.86 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  28 
 
 		 272 aa  103  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  29.91 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  31.11 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  29.91 
 
 		 272 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  31.86 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  27.31 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  30.43 
 
 		 284 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  24.68 
 
 		 273 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.07 
 
 		 272 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  28.51 
 
 		 272 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  29.71 
 
 		 302 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  27.75 
 
 		 272 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  30.7 
 
 		 267 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  28.63 
 
 		 218 aa  97.8  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  27.36 
 
 		 302 aa  97.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  31.6 
 
 		 299 aa  97.1  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  26.55 
 
 		 290 aa  96.7  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  30.3 
 
 		 330 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  32.38 
 
 		 284 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  27.27 
 
 		 274 aa  93.6  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 278 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.4 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  31.56 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  29.06 
 
 		 274 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  30.86 
 
 		 321 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1170  OmpA family protein  30.61 
 
 		 512 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  29.58 
 
 		 274 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  31.47 
 
 		 273 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  28.21 
 
 		 278 aa  90.5  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  27.75 
 
 		 285 aa  90.1  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  30.45 
 
 		 332 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  29.44 
 
 		 285 aa  90.1  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  30.7 
 
 		 280 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.1 
 
 		 278 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  29.75 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  29.34 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  30.45 
 
 		 332 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  29.34 
 
 		 323 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  28.02 
 
 		 269 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  29.34 
 
 		 323 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  29.34 
 
 		 323 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.63 
 
 		 276 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  30.24 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  29.34 
 
 		 323 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  27.42 
 
 		 279 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  29.63 
 
 		 332 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  29.2 
 
 		 278 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  26.72 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  29.31 
 
 		 273 aa  87.8  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  28.69 
 
 		 285 aa  87.4  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  30.04 
 
 		 332 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  30.33 
 
 		 323 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  29.8 
 
 		 333 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  29.84 
 
 		 323 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  27.87 
 
 		 322 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  29.05 
 
 		 323 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  29.34 
 
 		 323 aa  86.7  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  29.07 
 
 		 277 aa  87  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>