More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0023 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0023  OmpA  100 
 
 		 591 aa  1199    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  28.13 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  50.54 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  48.1 
 
 		 542 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  30.2 
 
 		 228 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  48.68 
 
 		 558 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  48.68 
 
 		 558 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  30.2 
 
 		 228 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  48.1 
 
 		 558 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  31.55 
 
 		 294 aa  80.1  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4332  hypothetical protein  54.29 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  54.93 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  30.4 
 
 		 241 aa  79  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50810  hypothetical protein  54.29 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  34.68 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  33.87 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  30.2 
 
 		 212 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  33.87 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  52.86 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  32.68 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  31.22 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  52.24 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  37.6 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  52.24 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  46.15 
 
 		 229 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 481 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 219 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  44.68 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  44.16 
 
 		 212 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  44.32 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  33.66 
 
 		 218 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 		 498 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  33.06 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  52.7 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  53.73 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  44.16 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  52.7 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  44.3 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  47.83 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  44.3 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1435  OmpA/MotB domain-containing protein  33.78 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.83553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  53.73 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  43.59 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  53.73 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  44.3 
 
 		 560 aa  70.5  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 244 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3854  OmpA/MotB  42.5 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0341238  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  33.93 
 
 		 367 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.95 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4117  ompA family protein  40.43 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.66 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19490  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.61 
 
 		 215 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  51.35 
 
 		 205 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  52.24 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  29.18 
 
 		 215 aa  69.3  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 248 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  46.48 
 
 		 168 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  43.37 
 
 		 533 aa  68.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  50.72 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  50.7 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  50.75 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  46.48 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  52.24 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  50.75 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  32.17 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  32.17 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  32.17 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  32.17 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  50.75 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  44.71 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  50.75 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  32.17 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  47.95 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  42.55 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  41.49 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40.66 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  31.47 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 623 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  50.75 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  50.75 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  50.75 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6672  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  50.75 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1149  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.825601  normal  0.159569 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  50.75 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  50.75 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  48.28 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  50.75 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  31.47 
 
 		 310 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.09 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1228  OmpA/MotB  45.71 
 
 		 364 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  45.68 
 
 		 229 aa  67  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  31.47 
 
 		 310 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>