198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3613 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3613  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3612  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  48.03 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.694677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2506  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  47.92 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000037877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2676  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  33.47 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0612561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0475  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  31.52 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1491  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.22 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000445289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.42 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  31.79 
 
 		 283 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  30.86 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  32.93 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  24.71 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  26.77 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  26.42 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  29.81 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  25.11 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.26 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  26.29 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  29.82 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  30.05 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  30.9 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  26.22 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  25.18 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3354  hypothetical protein  28.33 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  26.4 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  34.38 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  26.34 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  27.44 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  28.93 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5677  hypothetical protein  25.84 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  27.86 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  26.34 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  28.05 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  24.05 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.96 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  25.33 
 
 		 290 aa  72  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.15 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.62 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  25.11 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  21.98 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  24.18 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  25.27 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  28.29 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  24.89 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  25.39 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  29.17 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  31.87 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  24.02 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  26.56 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  27.38 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  24.91 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.55 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.11 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  24.52 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  25 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  25 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  33.79 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  24.68 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.11 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.88 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.04 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  26.25 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  29.06 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  29.22 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  24.62 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  27.27 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.07 
 
 		 302 aa  62  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4766  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate- binding protein  26.95 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.210627 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  29.14 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  23.81 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.79 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1584  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000121386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  28.39 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  31.16 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  26.27 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  26 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  27.87 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  26.53 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  30.41 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0311  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  30 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1384  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  24.82 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  26.06 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  28.48 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  24.65 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  28.7 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1989  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  27.87 
 
 		 630 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000844376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3331  extracellular solute-binding protein, family 1  23.47 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  28.1 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  23.4 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  24.73 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.11 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  26.79 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>