169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2506 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2506  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 
253 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000037877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3612  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  57.74 
 
 
254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.694677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3613  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  47.92 
 
 
252 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1491  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  34.3 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000445289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0475  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  32.8 
 
 
263 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2676  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  32.62 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0612561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.37 
 
 
326 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  28.95 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  30 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  28.29 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  29.14 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  29.8 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  27.44 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  30 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  29.76 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  28.66 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  29.19 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  26.98 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  28.66 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  26.48 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  31.54 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  28.67 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  30.07 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  25 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  31.25 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  36.45 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  25.28 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  27.11 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.41 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  28.83 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  25 
 
 
264 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5677  hypothetical protein  24.71 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253035  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  29.82 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  23.48 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  32.74 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  32.87 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.32 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  29.11 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  30.67 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 
435 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3354  hypothetical protein  31.69 
 
 
263 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  27.81 
 
 
282 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.74 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  25.76 
 
 
272 aa  62  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  24.84 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 
585 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  30.94 
 
 
303 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  27.6 
 
 
301 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  25.44 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  30.19 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  32.63 
 
 
332 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  32.21 
 
 
519 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  26.25 
 
 
307 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  24.85 
 
 
269 aa  59.3  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  25.11 
 
 
271 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  27.42 
 
 
428 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  29.05 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  25.32 
 
 
285 aa  58.9  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  28.14 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  25.88 
 
 
276 aa  58.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.19 
 
 
272 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  27.61 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  27.81 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.13 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  33.7 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  27.66 
 
 
460 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  31.76 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.12 
 
 
286 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.48 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  34.26 
 
 
286 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0005  extracellular solute-binding protein, family 1  28.95 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  46.88 
 
 
298 aa  57  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  22.6 
 
 
330 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  26.13 
 
 
284 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  27.16 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  30.19 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1989  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  37.31 
 
 
630 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000844376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  28.75 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.61 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.69 
 
 
302 aa  55.8  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  22.22 
 
 
288 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  32.17 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  23.68 
 
 
292 aa  55.5  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  24.22 
 
 
285 aa  55.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  28.67 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  27.27 
 
 
513 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  29.36 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  25.64 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0311  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.04 
 
 
325 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 
558 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  30.77 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  28.12 
 
 
292 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  26.62 
 
 
290 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  28.16 
 
 
464 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  36.17 
 
 
298 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  26.49 
 
 
465 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  23.6 
 
 
270 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  23.75 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 
268 aa  52.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>