156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1491 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1491  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000445289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2506  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  34.3 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000037877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3613  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  32.22 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3612  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  30.65 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.694677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2745  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  74.6 
 
 		 83 aa  99  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2676  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  29.65 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0612561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  27.47 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0475  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  26.61 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.4 
 
 		 326 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  32.86 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  30.88 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  24.45 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  26.24 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  25.68 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  23.66 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  29.71 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.89 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  27.18 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.05 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  29.58 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  28.68 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  24.72 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2837  hypothetical protein  37.37 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.126303  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  24.57 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1402  hypothetical protein  27.75 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.728708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  24.21 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2467  phosphate transport system substrate-binding protein  25.23 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  24.21 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  27.12 
 
 		 267 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.2 
 
 		 293 aa  62  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  28.68 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  21.69 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  24.02 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  29.79 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  30.43 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.29 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  23.86 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.86 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.86 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  23.86 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.9 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  24.55 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.86 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.86 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  38.1 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.74 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  40.96 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  28.91 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5677  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  27.31 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  26.8 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  28.91 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.97 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  31.91 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  25.74 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  27.01 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  22.69 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  24.06 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  31.25 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  28.91 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  26.04 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  26.47 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  27.21 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.32 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.94 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1881  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.32 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  25 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  22.67 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  25.18 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  24.6 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  27.42 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  24.07 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  22.5 
 
 		 558 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  25.55 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  21.66 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  23.05 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0139  hypothetical protein  28.39 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  25.53 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  28.26 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0889  hypothetical protein  53.19 
 
 		 444 aa  53.1  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.181137  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  25.63 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  39.51 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  23.3 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3551  ABC-type phosphate transport system, substrate binding protein  41.18 
 
 		 386 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0218  hypothetical protein  29.1 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.61 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  25.61 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.16 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  25.74 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6248  putative phosphate binding ABC transporter  24.41 
 
 		 510 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0983725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  25.11 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  26.11 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  25.74 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  25.55 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  22.31 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  32.04 
 
 		 416 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4314  phosphate ABC-transporter periplasmic phosphate-binding protein  28.16 
 
 		 349 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  23.08 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2212  putative phosphate ABC transporter  34.21 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  27.74 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>