42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1150 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  58.42 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  50.67 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  51.35 
 
 		 717 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  51.9 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  49.33 
 
 		 711 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  46.67 
 
 		 709 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  51.52 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  52.31 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  52.31 
 
 		 329 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  50.77 
 
 		 329 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  49.33 
 
 		 340 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  50 
 
 		 330 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  48.65 
 
 		 340 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  36.63 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  36.63 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  51.56 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  40.21 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  45.78 
 
 		 340 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  47.69 
 
 		 252 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  45.45 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  46.77 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  35.87 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  48.08 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  42.42 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  46.03 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  45.07 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  45.07 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  45.07 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  37.68 
 
 		 326 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  41.18 
 
 		 276 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  34.92 
 
 		 350 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3455  hypothetical protein  36.27 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000145754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3521  hypothetical protein  35.29 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.013022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  42.65 
 
 		 277 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0612  cytochrome c3  35.64 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000139054  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  34.92 
 
 		 199 aa  43.5  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1024  cytochrome c3  40 
 
 		 92 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0209  cytochrome c3  34.91 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3509  cytochrome c3  32.98 
 
 		 91 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>